Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C17orf47Q8NEP4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C17orf47Q8NEP4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C17orf47Q8NEP4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C17orf47Q8NEP4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C17orf47Q8NEP4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C17orf47Q8NEP4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C17orf47Q8NEP4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C17orf47Q8NEP4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C17orf47Q8NEP4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C17orf47Q8NEP4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C17orf47Q8NEP4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C17orf47Q8NEP4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C17orf47Q8NEP4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C17orf47Q8NEP4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C17orf47Q8NEP4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C17orf47Q8NEP4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C17orf47Q8NEP4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C17orf47Q8NEP4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C17orf47Q8NEP4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C17orf47Q8NEP4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C17orf47Q8NEP4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C17orf47Q8NEP4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C17orf47Q8NEP4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C17orf47Q8NEP4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C17orf47Q8NEP4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C17orf47Q8NEP4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C17orf47Q8NEP4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C17orf47Q8NEP4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C17orf47Q8NEP4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C17orf47Q8NEP4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C17orf47Q8NEP4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C17orf47Q8NEP4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C17orf47Q8NEP4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C17orf47Q8NEP4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C17orf47Q8NEP4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C17orf47Q8NEP4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C17orf47Q8NEP4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C17orf47Q8NEP4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C17orf47Q8NEP4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C17orf47Q8NEP4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C17orf47Q8NEP4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C17orf47Q8NEP4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C17orf47Q8NEP4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C17orf47Q8NEP4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C17orf47Q8NEP4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C17orf47Q8NEP4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C17orf47Q8NEP4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C17orf47Q8NEP4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C17orf47Q8NEP4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C17orf47Q8NEP4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C17orf47Q8NEP4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C17orf47Q8NEP4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C17orf47Q8NEP4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C17orf47Q8NEP4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C17orf47Q8NEP4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C17orf47Q8NEP4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C17orf47Q8NEP4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C17orf47Q8NEP4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C17orf47Q8NEP4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C17orf47Q8NEP4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C17orf47Q8NEP4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C17orf47Q8NEP4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C17orf47Q8NEP4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C17orf47Q8NEP4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C17orf47Q8NEP4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C17orf47Q8NEP4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C17orf47Q8NEP4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C17orf47Q8NEP4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C17orf47Q8NEP4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C17orf47Q8NEP4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C17orf47Q8NEP4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C17orf47Q8NEP4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C17orf47Q8NEP4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C17orf47Q8NEP4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C17orf47Q8NEP4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C17orf47Q8NEP4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C17orf47Q8NEP4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C17orf47Q8NEP4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C17orf47Q8NEP4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms