Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEG4

FAM83F, Protein FAM83F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM83FQ8NEG4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM83FQ8NEG4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM83FQ8NEG4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM83FQ8NEG4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM83FQ8NEG4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM83FQ8NEG4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM83FQ8NEG4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM83FQ8NEG4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM83FQ8NEG4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM83FQ8NEG4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM83FQ8NEG4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM83FQ8NEG4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM83FQ8NEG4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM83FQ8NEG4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM83FQ8NEG4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM83FQ8NEG4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM83FQ8NEG4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM83FQ8NEG4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM83FQ8NEG4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM83FQ8NEG4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM83FQ8NEG4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM83FQ8NEG4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM83FQ8NEG4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM83FQ8NEG4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM83FQ8NEG4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM83FQ8NEG4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM83FQ8NEG4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM83FQ8NEG4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM83FQ8NEG4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM83FQ8NEG4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM83FQ8NEG4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM83FQ8NEG4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM83FQ8NEG4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM83FQ8NEG4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM83FQ8NEG4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM83FQ8NEG4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM83FQ8NEG4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM83FQ8NEG4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM83FQ8NEG4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM83FQ8NEG4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM83FQ8NEG4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM83FQ8NEG4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM83FQ8NEG4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM83FQ8NEG4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM83FQ8NEG4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM83FQ8NEG4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM83FQ8NEG4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM83FQ8NEG4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM83FQ8NEG4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
FAM83FQ8NEG4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM83FQ8NEG4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM83FQ8NEG4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM83FQ8NEG4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM83FQ8NEG4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM83FQ8NEG4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM83FQ8NEG4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM83FQ8NEG4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM83FQ8NEG4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM83FQ8NEG4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM83FQ8NEG4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM83FQ8NEG4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM83FQ8NEG4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM83FQ8NEG4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM83FQ8NEG4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM83FQ8NEG4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM83FQ8NEG4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM83FQ8NEG4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM83FQ8NEG4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM83FQ8NEG4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM83FQ8NEG4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM83FQ8NEG4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM83FQ8NEG4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM83FQ8NEG4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM83FQ8NEG4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM83FQ8NEG4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM83FQ8NEG4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM83FQ8NEG4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM83FQ8NEG4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM83FQ8NEG4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM83FQ8NEG4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM83FQ8NEG4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM83FQ8NEG4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM83FQ8NEG4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM83FQ8NEG4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM83FQ8NEG4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM83FQ8NEG4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM83FQ8NEG4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM83FQ8NEG4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM83FQ8NEG4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM83FQ8NEG4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM83FQ8NEG4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM83FQ8NEG4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM83FQ8NEG4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM83FQ8NEG4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM83FQ8NEG4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM83FQ8NEG4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms