Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND24

RNF214, RING finger protein 214, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF214Q8ND24 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF214Q8ND24 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF214Q8ND24 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF214Q8ND24 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF214Q8ND24 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF214Q8ND24 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF214Q8ND24 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF214Q8ND24 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF214Q8ND24 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF214Q8ND24 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF214Q8ND24 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF214Q8ND24 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF214Q8ND24 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF214Q8ND24 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF214Q8ND24 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF214Q8ND24 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF214Q8ND24 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF214Q8ND24 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF214Q8ND24 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF214Q8ND24 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF214Q8ND24 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF214Q8ND24 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF214Q8ND24 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF214Q8ND24 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF214Q8ND24 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF214Q8ND24 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF214Q8ND24 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF214Q8ND24 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF214Q8ND24 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF214Q8ND24 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF214Q8ND24 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF214Q8ND24 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF214Q8ND24 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF214Q8ND24 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF214Q8ND24 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF214Q8ND24 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF214Q8ND24 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF214Q8ND24 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF214Q8ND24 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF214Q8ND24 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF214Q8ND24 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF214Q8ND24 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF214Q8ND24 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF214Q8ND24 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF214Q8ND24 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF214Q8ND24 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF214Q8ND24 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF214Q8ND24 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF214Q8ND24 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF214Q8ND24 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF214Q8ND24 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF214Q8ND24 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF214Q8ND24 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF214Q8ND24 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF214Q8ND24 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF214Q8ND24 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF214Q8ND24 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF214Q8ND24 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF214Q8ND24 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF214Q8ND24 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF214Q8ND24 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF214Q8ND24 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF214Q8ND24 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF214Q8ND24 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF214Q8ND24 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF214Q8ND24 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF214Q8ND24 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF214Q8ND24 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF214Q8ND24 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF214Q8ND24 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF214Q8ND24 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF214Q8ND24 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF214Q8ND24 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF214Q8ND24 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
RNF214Q8ND24 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RNF214Q8ND24 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF214Q8ND24 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF214Q8ND24 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF214Q8ND24 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF214Q8ND24 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF214Q8ND24 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF214Q8ND24 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF214Q8ND24 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF214Q8ND24 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF214Q8ND24 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF214Q8ND24 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF214Q8ND24 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF214Q8ND24 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF214Q8ND24 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF214Q8ND24 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF214Q8ND24 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF214Q8ND24 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF214Q8ND24 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF214Q8ND24 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF214Q8ND24 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF214Q8ND24 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF214Q8ND24 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF214Q8ND24 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF214Q8ND24 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF214Q8ND24 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms