Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC89Q8N998 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC89Q8N998 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC89Q8N998 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC89Q8N998 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC89Q8N998 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC89Q8N998 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC89Q8N998 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC89Q8N998 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC89Q8N998 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC89Q8N998 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC89Q8N998 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC89Q8N998 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC89Q8N998 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC89Q8N998 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC89Q8N998 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC89Q8N998 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC89Q8N998 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC89Q8N998 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC89Q8N998 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC89Q8N998 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC89Q8N998 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC89Q8N998 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC89Q8N998 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC89Q8N998 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC89Q8N998 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC89Q8N998 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC89Q8N998 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC89Q8N998 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC89Q8N998 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC89Q8N998 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC89Q8N998 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC89Q8N998 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC89Q8N998 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC89Q8N998 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC89Q8N998 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC89Q8N998 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC89Q8N998 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC89Q8N998 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC89Q8N998 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC89Q8N998 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC89Q8N998 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC89Q8N998 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC89Q8N998 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC89Q8N998 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC89Q8N998 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC89Q8N998 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC89Q8N998 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC89Q8N998 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC89Q8N998 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC89Q8N998 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC89Q8N998 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC89Q8N998 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC89Q8N998 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC89Q8N998 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC89Q8N998 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC89Q8N998 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC89Q8N998 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC89Q8N998 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC89Q8N998 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC89Q8N998 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC89Q8N998 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC89Q8N998 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC89Q8N998 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC89Q8N998 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC89Q8N998 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms