Protein–RNA interactions for Protein: Q8N535

LINC00471, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00471, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00471Q8N535 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00471Q8N535 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00471Q8N535 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00471Q8N535 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00471Q8N535 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00471Q8N535 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00471Q8N535 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00471Q8N535 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00471Q8N535 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00471Q8N535 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00471Q8N535 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00471Q8N535 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00471Q8N535 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00471Q8N535 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00471Q8N535 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00471Q8N535 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00471Q8N535 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00471Q8N535 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00471Q8N535 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00471Q8N535 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00471Q8N535 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00471Q8N535 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00471Q8N535 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00471Q8N535 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00471Q8N535 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00471Q8N535 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00471Q8N535 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00471Q8N535 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00471Q8N535 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00471Q8N535 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00471Q8N535 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00471Q8N535 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00471Q8N535 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00471Q8N535 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00471Q8N535 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00471Q8N535 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00471Q8N535 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00471Q8N535 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00471Q8N535 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00471Q8N535 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00471Q8N535 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00471Q8N535 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00471Q8N535 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00471Q8N535 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00471Q8N535 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00471Q8N535 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00471Q8N535 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00471Q8N535 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00471Q8N535 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00471Q8N535 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00471Q8N535 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00471Q8N535 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00471Q8N535 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00471Q8N535 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00471Q8N535 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00471Q8N535 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00471Q8N535 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00471Q8N535 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00471Q8N535 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00471Q8N535 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00471Q8N535 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LINC00471Q8N535 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LINC00471Q8N535 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00471Q8N535 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00471Q8N535 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00471Q8N535 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00471Q8N535 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00471Q8N535 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00471Q8N535 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00471Q8N535 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00471Q8N535 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00471Q8N535 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00471Q8N535 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00471Q8N535 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00471Q8N535 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00471Q8N535 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00471Q8N535 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00471Q8N535 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00471Q8N535 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00471Q8N535 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00471Q8N535 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00471Q8N535 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00471Q8N535 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00471Q8N535 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00471Q8N535 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00471Q8N535 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00471Q8N535 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00471Q8N535 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00471Q8N535 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LINC00471Q8N535 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00471Q8N535 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00471Q8N535 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00471Q8N535 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00471Q8N535 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00471Q8N535 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00471Q8N535 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00471Q8N535 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00471Q8N535 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00471Q8N535 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00471Q8N535 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms