Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LNX2Q8N448 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LNX2Q8N448 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNX2Q8N448 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNX2Q8N448 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNX2Q8N448 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LNX2Q8N448 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LNX2Q8N448 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LNX2Q8N448 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LNX2Q8N448 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LNX2Q8N448 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LNX2Q8N448 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LNX2Q8N448 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LNX2Q8N448 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LNX2Q8N448 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LNX2Q8N448 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LNX2Q8N448 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LNX2Q8N448 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LNX2Q8N448 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LNX2Q8N448 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LNX2Q8N448 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LNX2Q8N448 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LNX2Q8N448 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LNX2Q8N448 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LNX2Q8N448 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LNX2Q8N448 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LNX2Q8N448 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LNX2Q8N448 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LNX2Q8N448 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LNX2Q8N448 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LNX2Q8N448 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LNX2Q8N448 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LNX2Q8N448 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LNX2Q8N448 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNX2Q8N448 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNX2Q8N448 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNX2Q8N448 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNX2Q8N448 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNX2Q8N448 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNX2Q8N448 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNX2Q8N448 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNX2Q8N448 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LNX2Q8N448 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LNX2Q8N448 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LNX2Q8N448 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LNX2Q8N448 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LNX2Q8N448 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LNX2Q8N448 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LNX2Q8N448 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LNX2Q8N448 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNX2Q8N448 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNX2Q8N448 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNX2Q8N448 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNX2Q8N448 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNX2Q8N448 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNX2Q8N448 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNX2Q8N448 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNX2Q8N448 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNX2Q8N448 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNX2Q8N448 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNX2Q8N448 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNX2Q8N448 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LNX2Q8N448 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LNX2Q8N448 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LNX2Q8N448 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LNX2Q8N448 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LNX2Q8N448 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LNX2Q8N448 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms