Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYK2

CCDC105, Coiled-coil domain-containing protein 105, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC105Q8IYK2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC105Q8IYK2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC105Q8IYK2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC105Q8IYK2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC105Q8IYK2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC105Q8IYK2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC105Q8IYK2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC105Q8IYK2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC105Q8IYK2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC105Q8IYK2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC105Q8IYK2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC105Q8IYK2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC105Q8IYK2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC105Q8IYK2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC105Q8IYK2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC105Q8IYK2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC105Q8IYK2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC105Q8IYK2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC105Q8IYK2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC105Q8IYK2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC105Q8IYK2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC105Q8IYK2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC105Q8IYK2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC105Q8IYK2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC105Q8IYK2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC105Q8IYK2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC105Q8IYK2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC105Q8IYK2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC105Q8IYK2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC105Q8IYK2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC105Q8IYK2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC105Q8IYK2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC105Q8IYK2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC105Q8IYK2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC105Q8IYK2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC105Q8IYK2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC105Q8IYK2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC105Q8IYK2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC105Q8IYK2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC105Q8IYK2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC105Q8IYK2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC105Q8IYK2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC105Q8IYK2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC105Q8IYK2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC105Q8IYK2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC105Q8IYK2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC105Q8IYK2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC105Q8IYK2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC105Q8IYK2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC105Q8IYK2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC105Q8IYK2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC105Q8IYK2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC105Q8IYK2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC105Q8IYK2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC105Q8IYK2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC105Q8IYK2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC105Q8IYK2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC105Q8IYK2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC105Q8IYK2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC105Q8IYK2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC105Q8IYK2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC105Q8IYK2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC105Q8IYK2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms