Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW00

VSTM4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4Q8IW00 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
VSTM4Q8IW00 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VSTM4Q8IW00 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VSTM4Q8IW00 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
VSTM4Q8IW00 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
VSTM4Q8IW00 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VSTM4Q8IW00 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VSTM4Q8IW00 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VSTM4Q8IW00 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VSTM4Q8IW00 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
VSTM4Q8IW00 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VSTM4Q8IW00 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VSTM4Q8IW00 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VSTM4Q8IW00 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VSTM4Q8IW00 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
VSTM4Q8IW00 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VSTM4Q8IW00 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VSTM4Q8IW00 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VSTM4Q8IW00 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VSTM4Q8IW00 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VSTM4Q8IW00 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VSTM4Q8IW00 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VSTM4Q8IW00 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VSTM4Q8IW00 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VSTM4Q8IW00 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VSTM4Q8IW00 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VSTM4Q8IW00 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VSTM4Q8IW00 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
VSTM4Q8IW00 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VSTM4Q8IW00 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VSTM4Q8IW00 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VSTM4Q8IW00 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VSTM4Q8IW00 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VSTM4Q8IW00 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VSTM4Q8IW00 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VSTM4Q8IW00 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VSTM4Q8IW00 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VSTM4Q8IW00 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VSTM4Q8IW00 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VSTM4Q8IW00 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VSTM4Q8IW00 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VSTM4Q8IW00 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VSTM4Q8IW00 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VSTM4Q8IW00 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VSTM4Q8IW00 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VSTM4Q8IW00 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VSTM4Q8IW00 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VSTM4Q8IW00 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VSTM4Q8IW00 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VSTM4Q8IW00 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
VSTM4Q8IW00 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VSTM4Q8IW00 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VSTM4Q8IW00 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VSTM4Q8IW00 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VSTM4Q8IW00 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VSTM4Q8IW00 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VSTM4Q8IW00 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VSTM4Q8IW00 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VSTM4Q8IW00 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VSTM4Q8IW00 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VSTM4Q8IW00 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VSTM4Q8IW00 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VSTM4Q8IW00 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VSTM4Q8IW00 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VSTM4Q8IW00 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VSTM4Q8IW00 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VSTM4Q8IW00 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VSTM4Q8IW00 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VSTM4Q8IW00 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VSTM4Q8IW00 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VSTM4Q8IW00 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VSTM4Q8IW00 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VSTM4Q8IW00 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VSTM4Q8IW00 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
VSTM4Q8IW00 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VSTM4Q8IW00 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VSTM4Q8IW00 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VSTM4Q8IW00 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VSTM4Q8IW00 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
VSTM4Q8IW00 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VSTM4Q8IW00 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VSTM4Q8IW00 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
VSTM4Q8IW00 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VSTM4Q8IW00 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
VSTM4Q8IW00 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VSTM4Q8IW00 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VSTM4Q8IW00 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VSTM4Q8IW00 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VSTM4Q8IW00 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VSTM4Q8IW00 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VSTM4Q8IW00 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VSTM4Q8IW00 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VSTM4Q8IW00 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VSTM4Q8IW00 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VSTM4Q8IW00 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VSTM4Q8IW00 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VSTM4Q8IW00 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VSTM4Q8IW00 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VSTM4Q8IW00 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VSTM4Q8IW00 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms