Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RHBDF2Q6PJF5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RHBDF2Q6PJF5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RHBDF2Q6PJF5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RHBDF2Q6PJF5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RHBDF2Q6PJF5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RHBDF2Q6PJF5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RHBDF2Q6PJF5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RHBDF2Q6PJF5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RHBDF2Q6PJF5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RHBDF2Q6PJF5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHBDF2Q6PJF5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHBDF2Q6PJF5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHBDF2Q6PJF5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHBDF2Q6PJF5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHBDF2Q6PJF5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHBDF2Q6PJF5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RHBDF2Q6PJF5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RHBDF2Q6PJF5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RHBDF2Q6PJF5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RHBDF2Q6PJF5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RHBDF2Q6PJF5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RHBDF2Q6PJF5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RHBDF2Q6PJF5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RHBDF2Q6PJF5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RHBDF2Q6PJF5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RHBDF2Q6PJF5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RHBDF2Q6PJF5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RHBDF2Q6PJF5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHBDF2Q6PJF5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHBDF2Q6PJF5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHBDF2Q6PJF5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHBDF2Q6PJF5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHBDF2Q6PJF5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHBDF2Q6PJF5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHBDF2Q6PJF5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHBDF2Q6PJF5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHBDF2Q6PJF5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHBDF2Q6PJF5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHBDF2Q6PJF5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHBDF2Q6PJF5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHBDF2Q6PJF5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHBDF2Q6PJF5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHBDF2Q6PJF5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHBDF2Q6PJF5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RHBDF2Q6PJF5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHBDF2Q6PJF5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHBDF2Q6PJF5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHBDF2Q6PJF5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHBDF2Q6PJF5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHBDF2Q6PJF5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHBDF2Q6PJF5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RHBDF2Q6PJF5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RHBDF2Q6PJF5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RHBDF2Q6PJF5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RHBDF2Q6PJF5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RHBDF2Q6PJF5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RHBDF2Q6PJF5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RHBDF2Q6PJF5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RHBDF2Q6PJF5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RHBDF2Q6PJF5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RHBDF2Q6PJF5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RHBDF2Q6PJF5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RHBDF2Q6PJF5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RHBDF2Q6PJF5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RHBDF2Q6PJF5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RHBDF2Q6PJF5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RHBDF2Q6PJF5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RHBDF2Q6PJF5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RHBDF2Q6PJF5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RHBDF2Q6PJF5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RHBDF2Q6PJF5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RHBDF2Q6PJF5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RHBDF2Q6PJF5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RHBDF2Q6PJF5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RHBDF2Q6PJF5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RHBDF2Q6PJF5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RHBDF2Q6PJF5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RHBDF2Q6PJF5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RHBDF2Q6PJF5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RHBDF2Q6PJF5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RHBDF2Q6PJF5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RHBDF2Q6PJF5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RHBDF2Q6PJF5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RHBDF2Q6PJF5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RHBDF2Q6PJF5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RHBDF2Q6PJF5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RHBDF2Q6PJF5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RHBDF2Q6PJF5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RHBDF2Q6PJF5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RHBDF2Q6PJF5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms