Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CREB3L3Q68CJ9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CREB3L3Q68CJ9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CREB3L3Q68CJ9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CREB3L3Q68CJ9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CREB3L3Q68CJ9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CREB3L3Q68CJ9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CREB3L3Q68CJ9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CREB3L3Q68CJ9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CREB3L3Q68CJ9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CREB3L3Q68CJ9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CREB3L3Q68CJ9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CREB3L3Q68CJ9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CREB3L3Q68CJ9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CREB3L3Q68CJ9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CREB3L3Q68CJ9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CREB3L3Q68CJ9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CREB3L3Q68CJ9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CREB3L3Q68CJ9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CREB3L3Q68CJ9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CREB3L3Q68CJ9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CREB3L3Q68CJ9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CREB3L3Q68CJ9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CREB3L3Q68CJ9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CREB3L3Q68CJ9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CREB3L3Q68CJ9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CREB3L3Q68CJ9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CREB3L3Q68CJ9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CREB3L3Q68CJ9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CREB3L3Q68CJ9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CREB3L3Q68CJ9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CREB3L3Q68CJ9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CREB3L3Q68CJ9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CREB3L3Q68CJ9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CREB3L3Q68CJ9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CREB3L3Q68CJ9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CREB3L3Q68CJ9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CREB3L3Q68CJ9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CREB3L3Q68CJ9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CREB3L3Q68CJ9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CREB3L3Q68CJ9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CREB3L3Q68CJ9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CREB3L3Q68CJ9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CREB3L3Q68CJ9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CREB3L3Q68CJ9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CREB3L3Q68CJ9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CREB3L3Q68CJ9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CREB3L3Q68CJ9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CREB3L3Q68CJ9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CREB3L3Q68CJ9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CREB3L3Q68CJ9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CREB3L3Q68CJ9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CREB3L3Q68CJ9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CREB3L3Q68CJ9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CREB3L3Q68CJ9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CREB3L3Q68CJ9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CREB3L3Q68CJ9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CREB3L3Q68CJ9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CREB3L3Q68CJ9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CREB3L3Q68CJ9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CREB3L3Q68CJ9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CREB3L3Q68CJ9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms