Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GKAP1Q5VSY0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GKAP1Q5VSY0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GKAP1Q5VSY0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GKAP1Q5VSY0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GKAP1Q5VSY0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GKAP1Q5VSY0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GKAP1Q5VSY0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GKAP1Q5VSY0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GKAP1Q5VSY0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GKAP1Q5VSY0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GKAP1Q5VSY0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GKAP1Q5VSY0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GKAP1Q5VSY0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GKAP1Q5VSY0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GKAP1Q5VSY0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GKAP1Q5VSY0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GKAP1Q5VSY0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GKAP1Q5VSY0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GKAP1Q5VSY0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GKAP1Q5VSY0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GKAP1Q5VSY0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GKAP1Q5VSY0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GKAP1Q5VSY0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GKAP1Q5VSY0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GKAP1Q5VSY0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GKAP1Q5VSY0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GKAP1Q5VSY0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GKAP1Q5VSY0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GKAP1Q5VSY0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GKAP1Q5VSY0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GKAP1Q5VSY0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GKAP1Q5VSY0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GKAP1Q5VSY0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GKAP1Q5VSY0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GKAP1Q5VSY0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GKAP1Q5VSY0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GKAP1Q5VSY0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GKAP1Q5VSY0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GKAP1Q5VSY0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GKAP1Q5VSY0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GKAP1Q5VSY0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GKAP1Q5VSY0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GKAP1Q5VSY0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GKAP1Q5VSY0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GKAP1Q5VSY0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GKAP1Q5VSY0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GKAP1Q5VSY0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GKAP1Q5VSY0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GKAP1Q5VSY0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GKAP1Q5VSY0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GKAP1Q5VSY0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GKAP1Q5VSY0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GKAP1Q5VSY0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GKAP1Q5VSY0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GKAP1Q5VSY0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GKAP1Q5VSY0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GKAP1Q5VSY0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GKAP1Q5VSY0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GKAP1Q5VSY0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GKAP1Q5VSY0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GKAP1Q5VSY0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GKAP1Q5VSY0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GKAP1Q5VSY0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GKAP1Q5VSY0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GKAP1Q5VSY0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GKAP1Q5VSY0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GKAP1Q5VSY0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms