Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZFYVE27Q5T4F4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZFYVE27Q5T4F4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZFYVE27Q5T4F4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZFYVE27Q5T4F4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZFYVE27Q5T4F4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZFYVE27Q5T4F4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZFYVE27Q5T4F4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZFYVE27Q5T4F4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZFYVE27Q5T4F4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZFYVE27Q5T4F4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZFYVE27Q5T4F4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZFYVE27Q5T4F4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ZFYVE27Q5T4F4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZFYVE27Q5T4F4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZFYVE27Q5T4F4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZFYVE27Q5T4F4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZFYVE27Q5T4F4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZFYVE27Q5T4F4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZFYVE27Q5T4F4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZFYVE27Q5T4F4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZFYVE27Q5T4F4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZFYVE27Q5T4F4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZFYVE27Q5T4F4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ZFYVE27Q5T4F4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZFYVE27Q5T4F4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZFYVE27Q5T4F4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZFYVE27Q5T4F4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZFYVE27Q5T4F4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ZFYVE27Q5T4F4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZFYVE27Q5T4F4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZFYVE27Q5T4F4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZFYVE27Q5T4F4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZFYVE27Q5T4F4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZFYVE27Q5T4F4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZFYVE27Q5T4F4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZFYVE27Q5T4F4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZFYVE27Q5T4F4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ZFYVE27Q5T4F4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZFYVE27Q5T4F4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZFYVE27Q5T4F4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZFYVE27Q5T4F4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZFYVE27Q5T4F4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZFYVE27Q5T4F4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZFYVE27Q5T4F4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZFYVE27Q5T4F4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZFYVE27Q5T4F4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZFYVE27Q5T4F4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZFYVE27Q5T4F4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZFYVE27Q5T4F4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZFYVE27Q5T4F4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZFYVE27Q5T4F4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZFYVE27Q5T4F4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZFYVE27Q5T4F4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZFYVE27Q5T4F4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZFYVE27Q5T4F4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZFYVE27Q5T4F4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZFYVE27Q5T4F4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZFYVE27Q5T4F4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZFYVE27Q5T4F4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZFYVE27Q5T4F4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZFYVE27Q5T4F4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZFYVE27Q5T4F4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZFYVE27Q5T4F4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms