Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZK1Q5T2W1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZK1Q5T2W1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZK1Q5T2W1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZK1Q5T2W1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZK1Q5T2W1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZK1Q5T2W1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZK1Q5T2W1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZK1Q5T2W1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZK1Q5T2W1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZK1Q5T2W1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZK1Q5T2W1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZK1Q5T2W1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZK1Q5T2W1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZK1Q5T2W1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZK1Q5T2W1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZK1Q5T2W1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZK1Q5T2W1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZK1Q5T2W1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZK1Q5T2W1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZK1Q5T2W1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZK1Q5T2W1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZK1Q5T2W1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZK1Q5T2W1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZK1Q5T2W1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZK1Q5T2W1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.2 ms