Protein–RNA interactions for Protein: Q5RL73

RBM48, RNA-binding protein 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM48Q5RL73 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM48Q5RL73 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM48Q5RL73 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM48Q5RL73 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM48Q5RL73 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM48Q5RL73 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM48Q5RL73 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM48Q5RL73 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM48Q5RL73 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM48Q5RL73 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM48Q5RL73 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM48Q5RL73 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM48Q5RL73 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM48Q5RL73 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM48Q5RL73 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM48Q5RL73 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM48Q5RL73 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM48Q5RL73 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBM48Q5RL73 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBM48Q5RL73 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBM48Q5RL73 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBM48Q5RL73 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBM48Q5RL73 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBM48Q5RL73 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RBM48Q5RL73 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RBM48Q5RL73 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RBM48Q5RL73 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM48Q5RL73 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM48Q5RL73 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM48Q5RL73 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM48Q5RL73 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBM48Q5RL73 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM48Q5RL73 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBM48Q5RL73 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM48Q5RL73 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM48Q5RL73 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM48Q5RL73 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM48Q5RL73 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBM48Q5RL73 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM48Q5RL73 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM48Q5RL73 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM48Q5RL73 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM48Q5RL73 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM48Q5RL73 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM48Q5RL73 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBM48Q5RL73 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM48Q5RL73 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM48Q5RL73 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM48Q5RL73 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBM48Q5RL73 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM48Q5RL73 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM48Q5RL73 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM48Q5RL73 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM48Q5RL73 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM48Q5RL73 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM48Q5RL73 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM48Q5RL73 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM48Q5RL73 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM48Q5RL73 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM48Q5RL73 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM48Q5RL73 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM48Q5RL73 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM48Q5RL73 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM48Q5RL73 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM48Q5RL73 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms