Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMD4BQ5PRF9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMD4BQ5PRF9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMD4BQ5PRF9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMD4BQ5PRF9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMD4BQ5PRF9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMD4BQ5PRF9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMD4BQ5PRF9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMD4BQ5PRF9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMD4BQ5PRF9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMD4BQ5PRF9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMD4BQ5PRF9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMD4BQ5PRF9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMD4BQ5PRF9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMD4BQ5PRF9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMD4BQ5PRF9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMD4BQ5PRF9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMD4BQ5PRF9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMD4BQ5PRF9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMD4BQ5PRF9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SAMD4BQ5PRF9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SAMD4BQ5PRF9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAMD4BQ5PRF9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAMD4BQ5PRF9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAMD4BQ5PRF9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAMD4BQ5PRF9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAMD4BQ5PRF9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAMD4BQ5PRF9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAMD4BQ5PRF9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAMD4BQ5PRF9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAMD4BQ5PRF9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAMD4BQ5PRF9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAMD4BQ5PRF9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAMD4BQ5PRF9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAMD4BQ5PRF9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAMD4BQ5PRF9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SAMD4BQ5PRF9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAMD4BQ5PRF9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAMD4BQ5PRF9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAMD4BQ5PRF9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAMD4BQ5PRF9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAMD4BQ5PRF9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAMD4BQ5PRF9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAMD4BQ5PRF9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAMD4BQ5PRF9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAMD4BQ5PRF9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAMD4BQ5PRF9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAMD4BQ5PRF9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAMD4BQ5PRF9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAMD4BQ5PRF9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAMD4BQ5PRF9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAMD4BQ5PRF9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAMD4BQ5PRF9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAMD4BQ5PRF9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAMD4BQ5PRF9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAMD4BQ5PRF9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAMD4BQ5PRF9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAMD4BQ5PRF9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMD4BQ5PRF9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMD4BQ5PRF9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMD4BQ5PRF9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMD4BQ5PRF9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMD4BQ5PRF9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMD4BQ5PRF9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMD4BQ5PRF9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMD4BQ5PRF9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMD4BQ5PRF9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMD4BQ5PRF9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMD4BQ5PRF9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAMD4BQ5PRF9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SAMD4BQ5PRF9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAMD4BQ5PRF9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAMD4BQ5PRF9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAMD4BQ5PRF9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAMD4BQ5PRF9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAMD4BQ5PRF9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAMD4BQ5PRF9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMD4BQ5PRF9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMD4BQ5PRF9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMD4BQ5PRF9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAMD4BQ5PRF9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMD4BQ5PRF9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMD4BQ5PRF9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMD4BQ5PRF9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMD4BQ5PRF9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMD4BQ5PRF9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAMD4BQ5PRF9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAMD4BQ5PRF9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SAMD4BQ5PRF9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAMD4BQ5PRF9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAMD4BQ5PRF9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAMD4BQ5PRF9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAMD4BQ5PRF9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMD4BQ5PRF9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMD4BQ5PRF9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMD4BQ5PRF9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMD4BQ5PRF9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMD4BQ5PRF9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMD4BQ5PRF9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMD4BQ5PRF9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms