Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
PAN3Q58A45 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAN3Q58A45 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAN3Q58A45 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PAN3Q58A45 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PAN3Q58A45 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PAN3Q58A45 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PAN3Q58A45 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAN3Q58A45 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PAN3Q58A45 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAN3Q58A45 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PAN3Q58A45 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAN3Q58A45 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAN3Q58A45 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAN3Q58A45 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAN3Q58A45 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PAN3Q58A45 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAN3Q58A45 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAN3Q58A45 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PAN3Q58A45 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PAN3Q58A45 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAN3Q58A45 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAN3Q58A45 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PAN3Q58A45 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAN3Q58A45 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAN3Q58A45 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PAN3Q58A45 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAN3Q58A45 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAN3Q58A45 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAN3Q58A45 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PAN3Q58A45 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAN3Q58A45 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAN3Q58A45 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAN3Q58A45 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAN3Q58A45 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAN3Q58A45 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAN3Q58A45 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAN3Q58A45 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms