Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPAT3Q53EU6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPAT3Q53EU6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPAT3Q53EU6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GPAT3Q53EU6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPAT3Q53EU6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPAT3Q53EU6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPAT3Q53EU6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPAT3Q53EU6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPAT3Q53EU6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPAT3Q53EU6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPAT3Q53EU6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPAT3Q53EU6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPAT3Q53EU6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GPAT3Q53EU6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPAT3Q53EU6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPAT3Q53EU6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPAT3Q53EU6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPAT3Q53EU6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPAT3Q53EU6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPAT3Q53EU6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPAT3Q53EU6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPAT3Q53EU6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPAT3Q53EU6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPAT3Q53EU6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPAT3Q53EU6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPAT3Q53EU6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPAT3Q53EU6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPAT3Q53EU6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPAT3Q53EU6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPAT3Q53EU6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPAT3Q53EU6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPAT3Q53EU6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPAT3Q53EU6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPAT3Q53EU6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPAT3Q53EU6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPAT3Q53EU6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPAT3Q53EU6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPAT3Q53EU6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPAT3Q53EU6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPAT3Q53EU6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPAT3Q53EU6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPAT3Q53EU6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPAT3Q53EU6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPAT3Q53EU6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPAT3Q53EU6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPAT3Q53EU6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPAT3Q53EU6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPAT3Q53EU6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPAT3Q53EU6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPAT3Q53EU6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPAT3Q53EU6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPAT3Q53EU6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPAT3Q53EU6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPAT3Q53EU6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPAT3Q53EU6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPAT3Q53EU6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPAT3Q53EU6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPAT3Q53EU6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPAT3Q53EU6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPAT3Q53EU6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPAT3Q53EU6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPAT3Q53EU6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPAT3Q53EU6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms