Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY7

LRIT3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT3Q3SXY7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRIT3Q3SXY7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRIT3Q3SXY7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRIT3Q3SXY7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRIT3Q3SXY7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRIT3Q3SXY7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRIT3Q3SXY7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRIT3Q3SXY7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRIT3Q3SXY7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LRIT3Q3SXY7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRIT3Q3SXY7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRIT3Q3SXY7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRIT3Q3SXY7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRIT3Q3SXY7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRIT3Q3SXY7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRIT3Q3SXY7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRIT3Q3SXY7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRIT3Q3SXY7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRIT3Q3SXY7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRIT3Q3SXY7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRIT3Q3SXY7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRIT3Q3SXY7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRIT3Q3SXY7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LRIT3Q3SXY7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRIT3Q3SXY7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LRIT3Q3SXY7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRIT3Q3SXY7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRIT3Q3SXY7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LRIT3Q3SXY7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRIT3Q3SXY7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LRIT3Q3SXY7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRIT3Q3SXY7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRIT3Q3SXY7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRIT3Q3SXY7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LRIT3Q3SXY7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRIT3Q3SXY7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LRIT3Q3SXY7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRIT3Q3SXY7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LRIT3Q3SXY7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LRIT3Q3SXY7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRIT3Q3SXY7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRIT3Q3SXY7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LRIT3Q3SXY7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRIT3Q3SXY7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRIT3Q3SXY7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRIT3Q3SXY7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRIT3Q3SXY7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRIT3Q3SXY7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRIT3Q3SXY7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRIT3Q3SXY7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRIT3Q3SXY7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRIT3Q3SXY7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRIT3Q3SXY7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LRIT3Q3SXY7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LRIT3Q3SXY7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRIT3Q3SXY7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRIT3Q3SXY7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRIT3Q3SXY7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRIT3Q3SXY7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LRIT3Q3SXY7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRIT3Q3SXY7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRIT3Q3SXY7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRIT3Q3SXY7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRIT3Q3SXY7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRIT3Q3SXY7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRIT3Q3SXY7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LRIT3Q3SXY7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRIT3Q3SXY7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LRIT3Q3SXY7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRIT3Q3SXY7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRIT3Q3SXY7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRIT3Q3SXY7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRIT3Q3SXY7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRIT3Q3SXY7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRIT3Q3SXY7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRIT3Q3SXY7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRIT3Q3SXY7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRIT3Q3SXY7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRIT3Q3SXY7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LRIT3Q3SXY7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRIT3Q3SXY7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms