Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHB4

SLC5A12, Sodium-coupled monocarboxylate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A12Q1EHB4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A12Q1EHB4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A12Q1EHB4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A12Q1EHB4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A12Q1EHB4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A12Q1EHB4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A12Q1EHB4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A12Q1EHB4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A12Q1EHB4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A12Q1EHB4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A12Q1EHB4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A12Q1EHB4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A12Q1EHB4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A12Q1EHB4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A12Q1EHB4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A12Q1EHB4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A12Q1EHB4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A12Q1EHB4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A12Q1EHB4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A12Q1EHB4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A12Q1EHB4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A12Q1EHB4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A12Q1EHB4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A12Q1EHB4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A12Q1EHB4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A12Q1EHB4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A12Q1EHB4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A12Q1EHB4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A12Q1EHB4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A12Q1EHB4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A12Q1EHB4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A12Q1EHB4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A12Q1EHB4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A12Q1EHB4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A12Q1EHB4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A12Q1EHB4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A12Q1EHB4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A12Q1EHB4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A12Q1EHB4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A12Q1EHB4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A12Q1EHB4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A12Q1EHB4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A12Q1EHB4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A12Q1EHB4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A12Q1EHB4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A12Q1EHB4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A12Q1EHB4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A12Q1EHB4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A12Q1EHB4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A12Q1EHB4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A12Q1EHB4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A12Q1EHB4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A12Q1EHB4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A12Q1EHB4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A12Q1EHB4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC5A12Q1EHB4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A12Q1EHB4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A12Q1EHB4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A12Q1EHB4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A12Q1EHB4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A12Q1EHB4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A12Q1EHB4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A12Q1EHB4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A12Q1EHB4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A12Q1EHB4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A12Q1EHB4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A12Q1EHB4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A12Q1EHB4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A12Q1EHB4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A12Q1EHB4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms