Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZIC1Q15915 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZIC1Q15915 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZIC1Q15915 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZIC1Q15915 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZIC1Q15915 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZIC1Q15915 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZIC1Q15915 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZIC1Q15915 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZIC1Q15915 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZIC1Q15915 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZIC1Q15915 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZIC1Q15915 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZIC1Q15915 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZIC1Q15915 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZIC1Q15915 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZIC1Q15915 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZIC1Q15915 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZIC1Q15915 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZIC1Q15915 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZIC1Q15915 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZIC1Q15915 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZIC1Q15915 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZIC1Q15915 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZIC1Q15915 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZIC1Q15915 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZIC1Q15915 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZIC1Q15915 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZIC1Q15915 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZIC1Q15915 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZIC1Q15915 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZIC1Q15915 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZIC1Q15915 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZIC1Q15915 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZIC1Q15915 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZIC1Q15915 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZIC1Q15915 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZIC1Q15915 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZIC1Q15915 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZIC1Q15915 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZIC1Q15915 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZIC1Q15915 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZIC1Q15915 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZIC1Q15915 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZIC1Q15915 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZIC1Q15915 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZIC1Q15915 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZIC1Q15915 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZIC1Q15915 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZIC1Q15915 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZIC1Q15915 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZIC1Q15915 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZIC1Q15915 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZIC1Q15915 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZIC1Q15915 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZIC1Q15915 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZIC1Q15915 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZIC1Q15915 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZIC1Q15915 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZIC1Q15915 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZIC1Q15915 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZIC1Q15915 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZIC1Q15915 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZIC1Q15915 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZIC1Q15915 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZIC1Q15915 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZIC1Q15915 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms