Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPTX1Q15818 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPTX1Q15818 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPTX1Q15818 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPTX1Q15818 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPTX1Q15818 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPTX1Q15818 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPTX1Q15818 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPTX1Q15818 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPTX1Q15818 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPTX1Q15818 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPTX1Q15818 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPTX1Q15818 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPTX1Q15818 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPTX1Q15818 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPTX1Q15818 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPTX1Q15818 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPTX1Q15818 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPTX1Q15818 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPTX1Q15818 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPTX1Q15818 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPTX1Q15818 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NPTX1Q15818 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPTX1Q15818 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPTX1Q15818 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPTX1Q15818 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPTX1Q15818 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPTX1Q15818 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NPTX1Q15818 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPTX1Q15818 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPTX1Q15818 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPTX1Q15818 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPTX1Q15818 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPTX1Q15818 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPTX1Q15818 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NPTX1Q15818 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPTX1Q15818 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPTX1Q15818 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPTX1Q15818 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPTX1Q15818 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPTX1Q15818 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPTX1Q15818 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPTX1Q15818 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPTX1Q15818 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NPTX1Q15818 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPTX1Q15818 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPTX1Q15818 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPTX1Q15818 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPTX1Q15818 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPTX1Q15818 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPTX1Q15818 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPTX1Q15818 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPTX1Q15818 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPTX1Q15818 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPTX1Q15818 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPTX1Q15818 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NPTX1Q15818 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPTX1Q15818 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPTX1Q15818 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NPTX1Q15818 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPTX1Q15818 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPTX1Q15818 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPTX1Q15818 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPTX1Q15818 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPTX1Q15818 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPTX1Q15818 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NPTX1Q15818 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPTX1Q15818 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPTX1Q15818 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPTX1Q15818 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPTX1Q15818 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPTX1Q15818 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms