Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SS18Q15532 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SS18Q15532 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SS18Q15532 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SS18Q15532 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SS18Q15532 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SS18Q15532 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SS18Q15532 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SS18Q15532 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SS18Q15532 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SS18Q15532 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SS18Q15532 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SS18Q15532 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SS18Q15532 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SS18Q15532 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SS18Q15532 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SS18Q15532 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SS18Q15532 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SS18Q15532 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SS18Q15532 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SS18Q15532 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SS18Q15532 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SS18Q15532 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SS18Q15532 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SS18Q15532 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SS18Q15532 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SS18Q15532 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SS18Q15532 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SS18Q15532 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SS18Q15532 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SS18Q15532 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SS18Q15532 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SS18Q15532 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SS18Q15532 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SS18Q15532 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SS18Q15532 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SS18Q15532 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SS18Q15532 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SS18Q15532 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SS18Q15532 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SS18Q15532 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SS18Q15532 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SS18Q15532 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SS18Q15532 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SS18Q15532 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SS18Q15532 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SS18Q15532 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SS18Q15532 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SS18Q15532 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SS18Q15532 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SS18Q15532 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SS18Q15532 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SS18Q15532 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SS18Q15532 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SS18Q15532 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SS18Q15532 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SS18Q15532 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SS18Q15532 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SS18Q15532 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SS18Q15532 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SS18Q15532 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SS18Q15532 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SS18Q15532 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SS18Q15532 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SS18Q15532 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SS18Q15532 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SS18Q15532 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SS18Q15532 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SS18Q15532 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SS18Q15532 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SS18Q15532 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SS18Q15532 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SS18Q15532 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SS18Q15532 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SS18Q15532 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SS18Q15532 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SS18Q15532 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SS18Q15532 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SS18Q15532 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SS18Q15532 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SS18Q15532 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SS18Q15532 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SS18Q15532 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SS18Q15532 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SS18Q15532 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SS18Q15532 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SS18Q15532 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SS18Q15532 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SS18Q15532 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SS18Q15532 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SS18Q15532 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SS18Q15532 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SS18Q15532 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SS18Q15532 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SS18Q15532 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SS18Q15532 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SS18Q15532 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SS18Q15532 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SS18Q15532 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SS18Q15532 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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