Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 65.5
PCBP2Q15366 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.41■□□□□ 0.865e-10■■■■■ 65.4
PCBP2Q15366 CUX1-219ENST00000606749 601 ntTSL 47.04□□□□□ -1.281e-6■■■■■ 65.3
PCBP2Q15366 PCMTD1-205ENST00000521046 856 ntTSL 216.83■□□□□ 0.288e-16■■■■■ 65.1
PCBP2Q15366 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.258e-16■■■■■ 65.1
PCBP2Q15366 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.34e-14■■■■■ 65.1
PCBP2Q15366 NSD3-210ENST00000529223 1032 ntTSL 515.14■□□□□ 0.014e-14■■■■■ 65.1
PCBP2Q15366 NSD3-203ENST00000433384 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.574e-14■■■■■ 65.1
PCBP2Q15366 NSD3-202ENST00000317025 10776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.64e-14■■■■■ 65.1
PCBP2Q15366 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.434e-14■■■■■ 65.1
PCBP2Q15366 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.092e-8■■■■■ 65
PCBP2Q15366 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.012e-8■■■■■ 65
PCBP2Q15366 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.622e-8■■■■■ 65
PCBP2Q15366 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.117e-13■■■■■ 65
PCBP2Q15366 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.795e-9■■■■■ 64.9
PCBP2Q15366 TBC1D8-204ENST00000463469 561 ntTSL 414.56□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 64.9
PCBP2Q15366 NCOR2-215ENST00000458234 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)13.53□□□□□ -0.246e-7■■■■■ 64.9
PCBP2Q15366 KLHDC10-202ENST00000463413 503 ntTSL 224.08■■□□□ 1.452e-6■■■■■ 64.8
PCBP2Q15366 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 64.8
PCBP2Q15366 KLHDC10-203ENST00000468226 772 ntTSL 36.85□□□□□ -1.312e-6■■■■■ 64.8
PCBP2Q15366 ZCCHC7-203ENST00000461038 2793 ntTSL 1 (best)15.06■□□□□ 04e-7■■■■■ 64.7
PCBP2Q15366 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.174e-7■■■■■ 64.7
PCBP2Q15366 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.664e-7■■■■■ 64.7
PCBP2Q15366 SLC12A7-206ENST00000634447 3142 ntTSL 513.39□□□□□ -0.276e-7■■■■■ 64.5
PCBP2Q15366 PRKCZ-219ENST00000484419 519 ntTSL 224.03■■□□□ 1.442e-12■■■■■ 64.5
PCBP2Q15366 PRKCZ-224ENST00000503297 468 ntTSL 514.62□□□□□ -0.072e-12■■■■■ 64.5
PCBP2Q15366 KANSL1-217ENST00000638269 3365 ntTSL 59.74□□□□□ -0.858e-8■■■■■ 64.5
PCBP2Q15366 BCL3-206ENST00000473473 445 ntTSL 26.91□□□□□ -1.31e-18■■■■■ 64.4
PCBP2Q15366 KDM5A-210ENST00000544760 2338 ntTSL 218.9■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 64.4
PCBP2Q15366 KDM5A-201ENST00000399788 10763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.112e-6■■■■■ 64.4
PCBP2Q15366 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.463e-10■■■■■ 64.3
PCBP2Q15366 ARHGEF1-213ENST00000595897 2973 ntTSL 1 (best)17.04■□□□□ 0.325e-8■■■■■ 64.3
PCBP2Q15366 KANSL1-231ENST00000639853 1425 ntTSL 57.29□□□□□ -1.249e-8■■■■■ 64.2
PCBP2Q15366 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.895e-8■■■■■ 64.2
PCBP2Q15366 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.745e-8■■■■■ 64.2
PCBP2Q15366 SMURF1-203ENST00000472627 825 ntTSL 213.02□□□□□ -0.335e-8■■■■■ 64.2
PCBP2Q15366 CDC42BPA-203ENST00000366766 10610 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 64
PCBP2Q15366 CDC42BPA-202ENST00000366764 10445 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 64
PCBP2Q15366 CDC42BPA-205ENST00000366769 10855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 64
PCBP2Q15366 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.532e-6■■■■■ 64
PCBP2Q15366 CDC42BPA-209ENST00000448940 7355 ntTSL 1 (best)5.36□□□□□ -1.552e-6■■■■■ 64
PCBP2Q15366 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.572e-6■■■■■ 64
PCBP2Q15366 KIF2A-204ENST00000504883 783 ntTSL 29.03□□□□□ -0.962e-10■■■■■ 64
PCBP2Q15366 KIF2A-210ENST00000514082 874 ntTSL 1 (best)6.1□□□□□ -1.432e-10■■■■■ 64
PCBP2Q15366 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.462e-10■■■■■ 64
PCBP2Q15366 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.675e-8■■■■■ 63.8
PCBP2Q15366 HTT-208ENST00000510626 14438 ntTSL 1 (best)8.02□□□□□ -1.133e-9■■■■■ 63.8
PCBP2Q15366 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.193e-9■■■■■ 63.8
PCBP2Q15366 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.752e-18■■■■■ 63.6
PCBP2Q15366 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.52e-18■■■■■ 63.6
PCBP2Q15366 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.432e-18■■■■■ 63.6
PCBP2Q15366 ATAD2B-201ENST00000238789 8103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.742e-6■■■■■ 63.5
PCBP2Q15366 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.182e-15■■■■■ 63.4
PCBP2Q15366 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.057e-7■■■■■ 63.4
PCBP2Q15366 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.227e-7■■■■■ 63.4
PCBP2Q15366 HGD-210ENST00000494453 683 ntTSL 38.64□□□□□ -1.033e-9■■■■■ 63.4
PCBP2Q15366 HGD-204ENST00000475447 565 ntTSL 38.39□□□□□ -1.073e-9■■■■■ 63.4
PCBP2Q15366 HGD-203ENST00000470321 528 ntTSL 37.48□□□□□ -1.213e-9■■■■■ 63.4
PCBP2Q15366 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.416e-21■■■■■ 63.3
PCBP2Q15366 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.16e-21■■■■■ 63.3
PCBP2Q15366 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.376e-21■■■■■ 63.3
PCBP2Q15366 NRSN2-205ENST00000608467 504 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.376e-21■■■■■ 63.3
PCBP2Q15366 NRSN2-207ENST00000608875 941 ntTSL 312.15□□□□□ -0.466e-21■■■■■ 63.3
PCBP2Q15366 APBB2-218ENST00000509475 1486 ntTSL 218.15■□□□□ 0.52e-16■■■■■ 63.3
PCBP2Q15366 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.222e-16■■■■■ 63.3
PCBP2Q15366 APBB2-214ENST00000508593 3592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.552e-16■■■■■ 63.3
PCBP2Q15366 APBB2-201ENST00000295974 8972 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.822e-16■■■■■ 63.3
PCBP2Q15366 APBB2-224ENST00000513140 4166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.132e-16■■■■■ 63.3
PCBP2Q15366 APBB2-227ENST00000513611 2964 ntTSL 57.59□□□□□ -1.192e-16■■■■■ 63.3
PCBP2Q15366 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.486e-9■■■■■ 63.3
PCBP2Q15366 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.296e-9■■■■■ 63.3
PCBP2Q15366 PACSIN2-209ENST00000453079 505 ntTSL 24.61□□□□□ -1.676e-9■■■■■ 63.3
PCBP2Q15366 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.455e-11■■■■■ 63.3
PCBP2Q15366 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.145e-11■■■■■ 63.3
PCBP2Q15366 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.385e-11■■■■■ 63.3
PCBP2Q15366 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.222e-10■■■■■ 63
PCBP2Q15366 SRRM2-228ENST00000576878 1141 ntTSL 216.68■□□□□ 0.262e-19■■■■■ 63
PCBP2Q15366 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.352e-14■■■■■ 62.9
PCBP2Q15366 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.571e-6■■■■■ 62.8
PCBP2Q15366 BAIAP2L1-202ENST00000462558 1250 ntTSL 1 (best)16.23■□□□□ 0.194e-10■■■■■ 62.8
PCBP2Q15366 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.394e-10■■■■■ 62.8
PCBP2Q15366 NPAS2-204ENST00000448812 774 ntTSL 510.27□□□□□ -0.774e-8■■■■■ 62.7
PCBP2Q15366 NPAS2-211ENST00000492373 552 ntTSL 46.48□□□□□ -1.374e-8■■■■■ 62.7
PCBP2Q15366 NPAS2-209ENST00000486017 764 ntTSL 35.71□□□□□ -1.54e-8■■■■■ 62.7
PCBP2Q15366 MAEA-206ENST00000503693 1182 ntTSL 1 (best)18.42■□□□□ 0.541e-8■■■■■ 62.7
PCBP2Q15366 MAEA-218ENST00000513301 595 ntTSL 416.04■□□□□ 0.161e-8■■■■■ 62.7
PCBP2Q15366 MAEA-203ENST00000502558 570 ntTSL 216■□□□□ 0.151e-8■■■■■ 62.7
PCBP2Q15366 MAEA-216ENST00000512308 839 ntTSL 515.53■□□□□ 0.081e-8■■■■■ 62.7
PCBP2Q15366 MAEA-211ENST00000509254 598 ntTSL 414.91□□□□□ -0.021e-8■■■■■ 62.7
PCBP2Q15366 MAEA-205ENST00000503653 845 ntTSL 311.81□□□□□ -0.521e-8■■■■■ 62.7
PCBP2Q15366 U2SURP-211ENST00000488497 3557 ntTSL 1 (best)5.98□□□□□ -1.453e-88■■■■■ 62.7
PCBP2Q15366 U2SURP-212ENST00000488587 866 ntTSL 35.63□□□□□ -1.513e-88■■■■■ 62.7
PCBP2Q15366 U2SURP-207ENST00000472373 1182 ntTSL 25.45□□□□□ -1.543e-88■■■■■ 62.7
PCBP2Q15366 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.683e-88■■■■■ 62.7
PCBP2Q15366 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.763e-88■■■■■ 62.7
PCBP2Q15366 U2SURP-209ENST00000480029 2855 ntTSL 23.91□□□□□ -1.783e-88■■■■■ 62.7
PCBP2Q15366 U2SURP-203ENST00000463563 4364 ntTSL 23.11□□□□□ -1.913e-88■■■■■ 62.7
PCBP2Q15366 ZBTB41-202ENST00000467322 3779 ntTSL 22.42□□□□□ -2.025e-14■■■■■ 62.5
PCBP2Q15366 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.315e-14■■■■■ 62.5
PCBP2Q15366 TMEM120A-208ENST00000480538 668 ntTSL 216.7■□□□□ 0.263e-7■■■■■ 62.2
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