RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544760.1

KDM5A-210, Transcript of lysine demethylase 5A, humanhuman

TSL 2

Gene KDM5A, Length 2,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5A-210ENST00000544760 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.84■■■■□ 3.65
KDM5A-210ENST00000544760 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
KDM5A-210ENST00000544760 HRCP23327 699 aa33.9■■■■□ 3.02
KDM5A-210ENST00000544760 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.18■■■□□ 2.9
KDM5A-210ENST00000544760 MYT1Q01538 1121 aa33.15■■■□□ 2.9
KDM5A-210ENST00000544760 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.83■■■□□ 2.85
KDM5A-210ENST00000544760 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.55■■■□□ 2.8
KDM5A-210ENST00000544760 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP32.4■■■□□ 2.78
KDM5A-210ENST00000544760 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.25■■■□□ 2.75
KDM5A-210ENST00000544760 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.95■■■□□ 2.7
KDM5A-210ENST00000544760 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
KDM5A-210ENST00000544760 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.67
KDM5A-210ENST00000544760 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.7■■■□□ 2.66
KDM5A-210ENST00000544760 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
KDM5A-210ENST00000544760 ABCC9O60706 1549 aa31.63■■■□□ 2.65
KDM5A-210ENST00000544760 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
KDM5A-210ENST00000544760 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.63
KDM5A-210ENST00000544760 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.45■■■□□ 2.62
KDM5A-210ENST00000544760 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
KDM5A-210ENST00000544760 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.3■■■□□ 2.6
KDM5A-210ENST00000544760 NEUROD1Q13562 356 aa31.2■■■□□ 2.58
KDM5A-210ENST00000544760 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa31.1■■■□□ 2.57
KDM5A-210ENST00000544760 NACADO15069 1562 aa30.97■■■□□ 2.55
KDM5A-210ENST00000544760 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
KDM5A-210ENST00000544760 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.82■■■□□ 2.53
KDM5A-210ENST00000544760 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.78■■■□□ 2.52
KDM5A-210ENST00000544760 BCL11AQ9H165 835 aa30.55■■■□□ 2.48
KDM5A-210ENST00000544760 SCRIBQ14160 1630 aa30.42■■■□□ 2.46
KDM5A-210ENST00000544760 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
KDM5A-210ENST00000544760 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
KDM5A-210ENST00000544760 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.18■■■□□ 2.42
KDM5A-210ENST00000544760 ANP32EQ9BTT0 268 aa30.13■■■□□ 2.41
KDM5A-210ENST00000544760 TRIM41Q8WV44 630 aa29.99■■■□□ 2.39
KDM5A-210ENST00000544760 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
KDM5A-210ENST00000544760 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
KDM5A-210ENST00000544760 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.87■■■□□ 2.37
KDM5A-210ENST00000544760 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
KDM5A-210ENST00000544760 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.77■■■□□ 2.36
KDM5A-210ENST00000544760 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.76■■■□□ 2.35
KDM5A-210ENST00000544760 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
KDM5A-210ENST00000544760 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.34
KDM5A-210ENST00000544760 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.69■■■□□ 2.34
KDM5A-210ENST00000544760 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa29.6■■■□□ 2.33
KDM5A-210ENST00000544760 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
KDM5A-210ENST00000544760 ERICH6Q7L0X2 663 aa29.49■■■□□ 2.31
KDM5A-210ENST00000544760 MIER1Q8N108 512 aa29.49■■■□□ 2.31
KDM5A-210ENST00000544760 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.42■■■□□ 2.3
KDM5A-210ENST00000544760 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
KDM5A-210ENST00000544760 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.21■■■□□ 2.27
KDM5A-210ENST00000544760 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
KDM5A-210ENST00000544760 SMARCA4P51532 1647 aa29.16■■■□□ 2.26
KDM5A-210ENST00000544760 APLP2Q06481 763 aa29.15■■■□□ 2.26
KDM5A-210ENST00000544760 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
KDM5A-210ENST00000544760 WIZO95785 1651 aa28.96■■■□□ 2.23
KDM5A-210ENST00000544760 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.94■■■□□ 2.22
KDM5A-210ENST00000544760 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.89■■■□□ 2.22
KDM5A-210ENST00000544760 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.84■■■□□ 2.21
KDM5A-210ENST00000544760 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
KDM5A-210ENST00000544760 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.76■■■□□ 2.19
KDM5A-210ENST00000544760 SMARCA2P51531 1590 aa28.74■■■□□ 2.19
KDM5A-210ENST00000544760 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.7■■■□□ 2.19
KDM5A-210ENST00000544760 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
KDM5A-210ENST00000544760 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.64■■■□□ 2.18
KDM5A-210ENST00000544760 MSH5O43196 834 aa28.61■■■□□ 2.17
KDM5A-210ENST00000544760 NCAPD3P42695 1498 aa28.58■■■□□ 2.17
KDM5A-210ENST00000544760 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
KDM5A-210ENST00000544760 HMGXB3Q12766 1538 aa28.52■■■□□ 2.16
KDM5A-210ENST00000544760 FANCIQ9NVI1 1328 aa28.5■■■□□ 2.15
KDM5A-210ENST00000544760 BCANQ96GW7 911 aa28.49■■■□□ 2.15
KDM5A-210ENST00000544760 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
KDM5A-210ENST00000544760 FKBP8Q14318 412 aa28.45■■■□□ 2.14
KDM5A-210ENST00000544760 CEP162Q5TB80 1403 aa28.42■■■□□ 2.14
KDM5A-210ENST00000544760 DEKP35659 375 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
KDM5A-210ENST00000544760 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.34■■■□□ 2.13
KDM5A-210ENST00000544760 ERICH6BQ5W0A0 696 aa28.34■■■□□ 2.13
KDM5A-210ENST00000544760 NEFLP07196 543 aa28.26■■■□□ 2.11
KDM5A-210ENST00000544760 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.23■■■□□ 2.11
KDM5A-210ENST00000544760 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.22■■■□□ 2.11
KDM5A-210ENST00000544760 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
KDM5A-210ENST00000544760 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa28.16■■■□□ 2.1
KDM5A-210ENST00000544760 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
KDM5A-210ENST00000544760 ITGAEP38570 1179 aa28.09■■■□□ 2.09
KDM5A-210ENST00000544760 KCNH8Q96L42 1107 aa28.07■■■□□ 2.08
KDM5A-210ENST00000544760 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
KDM5A-210ENST00000544760 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
KDM5A-210ENST00000544760 CFTRP13569 1480 aa27.85■■■□□ 2.05
KDM5A-210ENST00000544760 EEA1Q15075 1411 aa27.84■■■□□ 2.05
KDM5A-210ENST00000544760 CCDC136Q96JN2 1154 aa27.83■■■□□ 2.05
KDM5A-210ENST00000544760 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.82■■■□□ 2.04
KDM5A-210ENST00000544760 ABCC8Q09428 1581 aa27.79■■■□□ 2.04
KDM5A-210ENST00000544760 GOLGA3Q08378 1498 aa27.75■■■□□ 2.03
KDM5A-210ENST00000544760 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
KDM5A-210ENST00000544760 PRDM2Q13029 1718 aa27.72■■■□□ 2.03
KDM5A-210ENST00000544760 CCER2I3L3R5 266 aa27.71■■■□□ 2.03
KDM5A-210ENST00000544760 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
KDM5A-210ENST00000544760 NESP48681 1621 aa27.68■■■□□ 2.02
KDM5A-210ENST00000544760 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.67■■■□□ 2.02
KDM5A-210ENST00000544760 SOGA1O94964 1423 aa27.67■■■□□ 2.02
KDM5A-210ENST00000544760 NBR1Q14596 966 aa27.66■■■□□ 2.02
KDM5A-210ENST00000544760 IL27Q8NEV9 243 aa27.64■■■□□ 2.02
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