Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KARSQ15046 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KARSQ15046 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KARSQ15046 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KARSQ15046 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KARSQ15046 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KARSQ15046 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KARSQ15046 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KARSQ15046 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KARSQ15046 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KARSQ15046 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KARSQ15046 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KARSQ15046 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KARSQ15046 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KARSQ15046 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KARSQ15046 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KARSQ15046 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KARSQ15046 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
KARSQ15046 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
KARSQ15046 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
KARSQ15046 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KARSQ15046 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KARSQ15046 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KARSQ15046 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KARSQ15046 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KARSQ15046 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
KARSQ15046 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
KARSQ15046 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
KARSQ15046 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
KARSQ15046 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
KARSQ15046 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
KARSQ15046 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
KARSQ15046 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
KARSQ15046 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
KARSQ15046 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KARSQ15046 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KARSQ15046 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KARSQ15046 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KARSQ15046 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KARSQ15046 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KARSQ15046 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KARSQ15046 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KARSQ15046 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KARSQ15046 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KARSQ15046 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KARSQ15046 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KARSQ15046 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KARSQ15046 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KARSQ15046 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KARSQ15046 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KARSQ15046 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KARSQ15046 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KARSQ15046 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KARSQ15046 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KARSQ15046 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KARSQ15046 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KARSQ15046 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KARSQ15046 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KARSQ15046 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KARSQ15046 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KARSQ15046 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KARSQ15046 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KARSQ15046 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KARSQ15046 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KARSQ15046 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KARSQ15046 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KARSQ15046 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KARSQ15046 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KARSQ15046 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KARSQ15046 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KARSQ15046 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KARSQ15046 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KARSQ15046 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KARSQ15046 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KARSQ15046 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KARSQ15046 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KARSQ15046 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KARSQ15046 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KARSQ15046 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KARSQ15046 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
KARSQ15046 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KARSQ15046 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KARSQ15046 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KARSQ15046 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KARSQ15046 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KARSQ15046 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KARSQ15046 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KARSQ15046 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KARSQ15046 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KARSQ15046 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KARSQ15046 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KARSQ15046 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KARSQ15046 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KARSQ15046 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KARSQ15046 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KARSQ15046 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KARSQ15046 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KARSQ15046 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KARSQ15046 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KARSQ15046 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
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