Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCA4Q14CN2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCA4Q14CN2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCA4Q14CN2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCA4Q14CN2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCA4Q14CN2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCA4Q14CN2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCA4Q14CN2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCA4Q14CN2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCA4Q14CN2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCA4Q14CN2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCA4Q14CN2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCA4Q14CN2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCA4Q14CN2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCA4Q14CN2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLCA4Q14CN2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCA4Q14CN2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCA4Q14CN2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCA4Q14CN2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCA4Q14CN2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCA4Q14CN2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCA4Q14CN2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCA4Q14CN2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCA4Q14CN2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCA4Q14CN2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCA4Q14CN2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCA4Q14CN2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCA4Q14CN2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCA4Q14CN2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCA4Q14CN2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCA4Q14CN2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCA4Q14CN2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCA4Q14CN2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCA4Q14CN2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCA4Q14CN2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCA4Q14CN2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCA4Q14CN2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCA4Q14CN2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCA4Q14CN2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCA4Q14CN2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCA4Q14CN2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCA4Q14CN2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCA4Q14CN2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCA4Q14CN2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCA4Q14CN2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCA4Q14CN2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLCA4Q14CN2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCA4Q14CN2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCA4Q14CN2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCA4Q14CN2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCA4Q14CN2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCA4Q14CN2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCA4Q14CN2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCA4Q14CN2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCA4Q14CN2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCA4Q14CN2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCA4Q14CN2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCA4Q14CN2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCA4Q14CN2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCA4Q14CN2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCA4Q14CN2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCA4Q14CN2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCA4Q14CN2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
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