Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIGQ13278 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIGQ13278 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIGQ13278 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIGQ13278 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RIGQ13278 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RIGQ13278 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RIGQ13278 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RIGQ13278 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RIGQ13278 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
RIGQ13278 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RIGQ13278 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RIGQ13278 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RIGQ13278 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RIGQ13278 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RIGQ13278 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RIGQ13278 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RIGQ13278 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RIGQ13278 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RIGQ13278 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RIGQ13278 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RIGQ13278 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RIGQ13278 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RIGQ13278 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RIGQ13278 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIGQ13278 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIGQ13278 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIGQ13278 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIGQ13278 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIGQ13278 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RIGQ13278 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIGQ13278 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIGQ13278 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIGQ13278 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIGQ13278 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIGQ13278 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIGQ13278 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIGQ13278 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIGQ13278 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RIGQ13278 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RIGQ13278 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RIGQ13278 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RIGQ13278 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RIGQ13278 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RIGQ13278 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
RIGQ13278 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RIGQ13278 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RIGQ13278 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RIGQ13278 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RIGQ13278 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIGQ13278 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIGQ13278 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIGQ13278 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIGQ13278 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RIGQ13278 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIGQ13278 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIGQ13278 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIGQ13278 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIGQ13278 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIGQ13278 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIGQ13278 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RIGQ13278 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIGQ13278 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIGQ13278 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIGQ13278 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIGQ13278 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RIGQ13278 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIGQ13278 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIGQ13278 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIGQ13278 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIGQ13278 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIGQ13278 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RIGQ13278 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RIGQ13278 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIGQ13278 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIGQ13278 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIGQ13278 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIGQ13278 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RIGQ13278 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RIGQ13278 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RIGQ13278 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RIGQ13278 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RIGQ13278 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIGQ13278 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIGQ13278 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIGQ13278 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIGQ13278 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIGQ13278 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RIGQ13278 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIGQ13278 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIGQ13278 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIGQ13278 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIGQ13278 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIGQ13278 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIGQ13278 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIGQ13278 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIGQ13278 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIGQ13278 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIGQ13278 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIGQ13278 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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