Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBBP4Q09028 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBBP4Q09028 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBBP4Q09028 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBBP4Q09028 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBBP4Q09028 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBBP4Q09028 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBBP4Q09028 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBBP4Q09028 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBBP4Q09028 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RBBP4Q09028 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBBP4Q09028 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBBP4Q09028 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBBP4Q09028 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBBP4Q09028 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBBP4Q09028 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBBP4Q09028 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP4Q09028 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP4Q09028 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP4Q09028 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP4Q09028 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBBP4Q09028 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RBBP4Q09028 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBBP4Q09028 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBBP4Q09028 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBBP4Q09028 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBBP4Q09028 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBBP4Q09028 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBBP4Q09028 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBBP4Q09028 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBBP4Q09028 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBBP4Q09028 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBBP4Q09028 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBBP4Q09028 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBBP4Q09028 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBBP4Q09028 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBBP4Q09028 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBBP4Q09028 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBBP4Q09028 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBBP4Q09028 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RBBP4Q09028 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBBP4Q09028 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBBP4Q09028 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP4Q09028 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP4Q09028 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP4Q09028 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP4Q09028 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBBP4Q09028 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBBP4Q09028 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBBP4Q09028 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBBP4Q09028 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBBP4Q09028 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBBP4Q09028 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP4Q09028 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP4Q09028 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP4Q09028 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP4Q09028 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP4Q09028 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP4Q09028 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP4Q09028 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP4Q09028 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP4Q09028 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP4Q09028 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP4Q09028 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP4Q09028 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP4Q09028 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP4Q09028 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP4Q09028 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP4Q09028 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP4Q09028 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP4Q09028 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBBP4Q09028 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBBP4Q09028 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBBP4Q09028 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBBP4Q09028 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBBP4Q09028 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RBBP4Q09028 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBBP4Q09028 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBBP4Q09028 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP4Q09028 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP4Q09028 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP4Q09028 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBBP4Q09028 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBBP4Q09028 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBBP4Q09028 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBBP4Q09028 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBBP4Q09028 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBBP4Q09028 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP4Q09028 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP4Q09028 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP4Q09028 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP4Q09028 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP4Q09028 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP4Q09028 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP4Q09028 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBBP4Q09028 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RBBP4Q09028 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBBP4Q09028 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBBP4Q09028 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBBP4Q09028 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.7 ms