Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH3

ACSM2A, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM2AQ08AH3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACSM2AQ08AH3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSM2AQ08AH3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSM2AQ08AH3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSM2AQ08AH3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSM2AQ08AH3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACSM2AQ08AH3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACSM2AQ08AH3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSM2AQ08AH3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSM2AQ08AH3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSM2AQ08AH3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSM2AQ08AH3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSM2AQ08AH3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSM2AQ08AH3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSM2AQ08AH3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSM2AQ08AH3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSM2AQ08AH3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSM2AQ08AH3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSM2AQ08AH3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSM2AQ08AH3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSM2AQ08AH3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSM2AQ08AH3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSM2AQ08AH3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSM2AQ08AH3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSM2AQ08AH3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSM2AQ08AH3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSM2AQ08AH3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSM2AQ08AH3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSM2AQ08AH3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSM2AQ08AH3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSM2AQ08AH3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSM2AQ08AH3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSM2AQ08AH3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSM2AQ08AH3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
ACSM2AQ08AH3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSM2AQ08AH3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSM2AQ08AH3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSM2AQ08AH3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSM2AQ08AH3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSM2AQ08AH3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSM2AQ08AH3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ACSM2AQ08AH3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ACSM2AQ08AH3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ACSM2AQ08AH3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACSM2AQ08AH3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACSM2AQ08AH3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACSM2AQ08AH3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACSM2AQ08AH3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSM2AQ08AH3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSM2AQ08AH3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSM2AQ08AH3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSM2AQ08AH3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSM2AQ08AH3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSM2AQ08AH3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSM2AQ08AH3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSM2AQ08AH3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSM2AQ08AH3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSM2AQ08AH3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSM2AQ08AH3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSM2AQ08AH3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSM2AQ08AH3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSM2AQ08AH3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSM2AQ08AH3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACSM2AQ08AH3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACSM2AQ08AH3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSM2AQ08AH3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSM2AQ08AH3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSM2AQ08AH3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSM2AQ08AH3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSM2AQ08AH3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACSM2AQ08AH3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACSM2AQ08AH3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACSM2AQ08AH3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACSM2AQ08AH3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACSM2AQ08AH3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSM2AQ08AH3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSM2AQ08AH3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSM2AQ08AH3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSM2AQ08AH3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSM2AQ08AH3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSM2AQ08AH3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSM2AQ08AH3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSM2AQ08AH3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSM2AQ08AH3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSM2AQ08AH3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSM2AQ08AH3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSM2AQ08AH3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSM2AQ08AH3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACSM2AQ08AH3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACSM2AQ08AH3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACSM2AQ08AH3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACSM2AQ08AH3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACSM2AQ08AH3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACSM2AQ08AH3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACSM2AQ08AH3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ACSM2AQ08AH3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACSM2AQ08AH3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACSM2AQ08AH3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACSM2AQ08AH3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACSM2AQ08AH3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms