Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP4F3Q08477 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP4F3Q08477 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP4F3Q08477 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP4F3Q08477 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP4F3Q08477 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP4F3Q08477 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP4F3Q08477 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP4F3Q08477 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP4F3Q08477 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYP4F3Q08477 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYP4F3Q08477 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYP4F3Q08477 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYP4F3Q08477 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYP4F3Q08477 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYP4F3Q08477 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYP4F3Q08477 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYP4F3Q08477 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYP4F3Q08477 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYP4F3Q08477 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYP4F3Q08477 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP4F3Q08477 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP4F3Q08477 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP4F3Q08477 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP4F3Q08477 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP4F3Q08477 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP4F3Q08477 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP4F3Q08477 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP4F3Q08477 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP4F3Q08477 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP4F3Q08477 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYP4F3Q08477 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYP4F3Q08477 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYP4F3Q08477 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYP4F3Q08477 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYP4F3Q08477 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYP4F3Q08477 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYP4F3Q08477 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYP4F3Q08477 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYP4F3Q08477 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYP4F3Q08477 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYP4F3Q08477 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYP4F3Q08477 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CYP4F3Q08477 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP4F3Q08477 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP4F3Q08477 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYP4F3Q08477 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYP4F3Q08477 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYP4F3Q08477 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYP4F3Q08477 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYP4F3Q08477 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYP4F3Q08477 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYP4F3Q08477 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYP4F3Q08477 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CYP4F3Q08477 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYP4F3Q08477 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CYP4F3Q08477 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYP4F3Q08477 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYP4F3Q08477 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYP4F3Q08477 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYP4F3Q08477 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP4F3Q08477 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP4F3Q08477 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP4F3Q08477 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP4F3Q08477 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP4F3Q08477 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP4F3Q08477 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP4F3Q08477 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP4F3Q08477 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYP4F3Q08477 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CYP4F3Q08477 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP4F3Q08477 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP4F3Q08477 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP4F3Q08477 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYP4F3Q08477 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYP4F3Q08477 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYP4F3Q08477 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYP4F3Q08477 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYP4F3Q08477 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP4F3Q08477 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP4F3Q08477 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP4F3Q08477 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP4F3Q08477 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP4F3Q08477 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP4F3Q08477 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CYP4F3Q08477 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP4F3Q08477 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP4F3Q08477 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP4F3Q08477 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP4F3Q08477 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP4F3Q08477 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP4F3Q08477 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP4F3Q08477 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP4F3Q08477 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP4F3Q08477 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP4F3Q08477 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP4F3Q08477 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP4F3Q08477 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4F3Q08477 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP4F3Q08477 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms