Protein–RNA interactions for Protein: Q08174

PCDH1, Protocadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH1Q08174 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH1Q08174 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH1Q08174 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH1Q08174 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH1Q08174 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH1Q08174 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH1Q08174 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH1Q08174 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDH1Q08174 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDH1Q08174 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDH1Q08174 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDH1Q08174 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDH1Q08174 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDH1Q08174 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDH1Q08174 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDH1Q08174 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH1Q08174 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH1Q08174 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH1Q08174 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH1Q08174 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH1Q08174 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH1Q08174 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH1Q08174 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH1Q08174 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDH1Q08174 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDH1Q08174 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDH1Q08174 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDH1Q08174 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDH1Q08174 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDH1Q08174 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDH1Q08174 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDH1Q08174 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDH1Q08174 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDH1Q08174 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH1Q08174 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH1Q08174 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH1Q08174 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH1Q08174 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH1Q08174 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH1Q08174 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH1Q08174 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH1Q08174 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH1Q08174 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH1Q08174 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH1Q08174 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDH1Q08174 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDH1Q08174 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDH1Q08174 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDH1Q08174 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH1Q08174 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH1Q08174 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH1Q08174 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH1Q08174 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH1Q08174 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH1Q08174 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH1Q08174 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDH1Q08174 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDH1Q08174 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDH1Q08174 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH1Q08174 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH1Q08174 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH1Q08174 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH1Q08174 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH1Q08174 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH1Q08174 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH1Q08174 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH1Q08174 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDH1Q08174 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDH1Q08174 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDH1Q08174 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDH1Q08174 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.7 ms