Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRKCZQ05513 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRKCZQ05513 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRKCZQ05513 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRKCZQ05513 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKCZQ05513 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKCZQ05513 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKCZQ05513 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKCZQ05513 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRKCZQ05513 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRKCZQ05513 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRKCZQ05513 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRKCZQ05513 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRKCZQ05513 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PRKCZQ05513 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRKCZQ05513 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRKCZQ05513 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRKCZQ05513 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRKCZQ05513 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRKCZQ05513 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRKCZQ05513 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRKCZQ05513 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRKCZQ05513 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRKCZQ05513 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRKCZQ05513 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKCZQ05513 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKCZQ05513 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKCZQ05513 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKCZQ05513 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKCZQ05513 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKCZQ05513 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKCZQ05513 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKCZQ05513 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKCZQ05513 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRKCZQ05513 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRKCZQ05513 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRKCZQ05513 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRKCZQ05513 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRKCZQ05513 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRKCZQ05513 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRKCZQ05513 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRKCZQ05513 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRKCZQ05513 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRKCZQ05513 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PRKCZQ05513 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PRKCZQ05513 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PRKCZQ05513 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PRKCZQ05513 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKCZQ05513 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKCZQ05513 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKCZQ05513 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKCZQ05513 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRKCZQ05513 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRKCZQ05513 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKCZQ05513 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKCZQ05513 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKCZQ05513 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKCZQ05513 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKCZQ05513 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKCZQ05513 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKCZQ05513 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRKCZQ05513 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKCZQ05513 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKCZQ05513 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKCZQ05513 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKCZQ05513 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKCZQ05513 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKCZQ05513 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKCZQ05513 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKCZQ05513 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKCZQ05513 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKCZQ05513 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKCZQ05513 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKCZQ05513 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKCZQ05513 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKCZQ05513 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKCZQ05513 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKCZQ05513 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKCZQ05513 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKCZQ05513 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKCZQ05513 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKCZQ05513 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKCZQ05513 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRKCZQ05513 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKCZQ05513 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRKCZQ05513 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRKCZQ05513 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRKCZQ05513 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms