Protein–RNA interactions for Protein: Q03252

LMNB2, Lamin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB2Q03252 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMNB2Q03252 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMNB2Q03252 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMNB2Q03252 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMNB2Q03252 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMNB2Q03252 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LMNB2Q03252 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMNB2Q03252 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMNB2Q03252 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMNB2Q03252 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMNB2Q03252 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMNB2Q03252 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMNB2Q03252 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LMNB2Q03252 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMNB2Q03252 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMNB2Q03252 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMNB2Q03252 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMNB2Q03252 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMNB2Q03252 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMNB2Q03252 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMNB2Q03252 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMNB2Q03252 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LMNB2Q03252 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMNB2Q03252 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMNB2Q03252 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMNB2Q03252 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMNB2Q03252 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMNB2Q03252 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMNB2Q03252 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LMNB2Q03252 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMNB2Q03252 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMNB2Q03252 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LMNB2Q03252 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LMNB2Q03252 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMNB2Q03252 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMNB2Q03252 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMNB2Q03252 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMNB2Q03252 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMNB2Q03252 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMNB2Q03252 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMNB2Q03252 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMNB2Q03252 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMNB2Q03252 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMNB2Q03252 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMNB2Q03252 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMNB2Q03252 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMNB2Q03252 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LMNB2Q03252 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMNB2Q03252 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMNB2Q03252 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMNB2Q03252 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMNB2Q03252 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMNB2Q03252 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMNB2Q03252 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMNB2Q03252 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMNB2Q03252 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMNB2Q03252 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms