Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DSG1Q02413 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DSG1Q02413 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DSG1Q02413 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DSG1Q02413 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DSG1Q02413 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DSG1Q02413 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DSG1Q02413 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DSG1Q02413 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DSG1Q02413 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DSG1Q02413 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DSG1Q02413 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DSG1Q02413 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
DSG1Q02413 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DSG1Q02413 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DSG1Q02413 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DSG1Q02413 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DSG1Q02413 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DSG1Q02413 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DSG1Q02413 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DSG1Q02413 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DSG1Q02413 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DSG1Q02413 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DSG1Q02413 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
DSG1Q02413 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DSG1Q02413 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DSG1Q02413 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DSG1Q02413 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DSG1Q02413 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DSG1Q02413 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DSG1Q02413 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DSG1Q02413 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
DSG1Q02413 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DSG1Q02413 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DSG1Q02413 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DSG1Q02413 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DSG1Q02413 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DSG1Q02413 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DSG1Q02413 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DSG1Q02413 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DSG1Q02413 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DSG1Q02413 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DSG1Q02413 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DSG1Q02413 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DSG1Q02413 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DSG1Q02413 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DSG1Q02413 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DSG1Q02413 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DSG1Q02413 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
DSG1Q02413 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DSG1Q02413 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DSG1Q02413 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DSG1Q02413 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DSG1Q02413 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DSG1Q02413 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DSG1Q02413 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DSG1Q02413 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DSG1Q02413 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DSG1Q02413 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DSG1Q02413 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DSG1Q02413 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
DSG1Q02413 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DSG1Q02413 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DSG1Q02413 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DSG1Q02413 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DSG1Q02413 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DSG1Q02413 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DSG1Q02413 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DSG1Q02413 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DSG1Q02413 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DSG1Q02413 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DSG1Q02413 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DSG1Q02413 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DSG1Q02413 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSG1Q02413 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSG1Q02413 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSG1Q02413 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSG1Q02413 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSG1Q02413 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
DSG1Q02413 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSG1Q02413 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSG1Q02413 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSG1Q02413 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DSG1Q02413 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DSG1Q02413 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DSG1Q02413 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DSG1Q02413 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DSG1Q02413 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSG1Q02413 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSG1Q02413 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSG1Q02413 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DSG1Q02413 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DSG1Q02413 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DSG1Q02413 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
DSG1Q02413 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DSG1Q02413 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DSG1Q02413 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DSG1Q02413 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DSG1Q02413 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DSG1Q02413 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms