Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSF1Q00613 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSF1Q00613 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSF1Q00613 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSF1Q00613 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSF1Q00613 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSF1Q00613 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSF1Q00613 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSF1Q00613 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSF1Q00613 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HSF1Q00613 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HSF1Q00613 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HSF1Q00613 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HSF1Q00613 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HSF1Q00613 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HSF1Q00613 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HSF1Q00613 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HSF1Q00613 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HSF1Q00613 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HSF1Q00613 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HSF1Q00613 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HSF1Q00613 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HSF1Q00613 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HSF1Q00613 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HSF1Q00613 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HSF1Q00613 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HSF1Q00613 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HSF1Q00613 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HSF1Q00613 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HSF1Q00613 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HSF1Q00613 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HSF1Q00613 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HSF1Q00613 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HSF1Q00613 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HSF1Q00613 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HSF1Q00613 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HSF1Q00613 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HSF1Q00613 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HSF1Q00613 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HSF1Q00613 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HSF1Q00613 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HSF1Q00613 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HSF1Q00613 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HSF1Q00613 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSF1Q00613 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSF1Q00613 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSF1Q00613 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSF1Q00613 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSF1Q00613 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSF1Q00613 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSF1Q00613 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSF1Q00613 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSF1Q00613 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSF1Q00613 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HSF1Q00613 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSF1Q00613 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HSF1Q00613 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSF1Q00613 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HSF1Q00613 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HSF1Q00613 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms