Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SH3BP2P78314 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3BP2P78314 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3BP2P78314 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3BP2P78314 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3BP2P78314 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3BP2P78314 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3BP2P78314 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2P78314 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2P78314 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2P78314 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2P78314 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2P78314 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2P78314 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2P78314 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2P78314 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2P78314 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2P78314 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2P78314 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2P78314 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2P78314 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2P78314 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3BP2P78314 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3BP2P78314 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3BP2P78314 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3BP2P78314 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2P78314 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2P78314 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2P78314 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2P78314 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2P78314 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2P78314 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2P78314 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2P78314 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2P78314 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2P78314 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2P78314 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2P78314 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2P78314 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2P78314 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2P78314 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2P78314 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2P78314 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2P78314 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2P78314 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2P78314 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2P78314 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2P78314 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3BP2P78314 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3BP2P78314 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3BP2P78314 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2P78314 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2P78314 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2P78314 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2P78314 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3BP2P78314 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3BP2P78314 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3BP2P78314 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3BP2P78314 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3BP2P78314 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3BP2P78314 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3BP2P78314 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3BP2P78314 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3BP2P78314 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3BP2P78314 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3BP2P78314 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3BP2P78314 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3BP2P78314 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3BP2P78314 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3BP2P78314 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3BP2P78314 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3BP2P78314 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3BP2P78314 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3BP2P78314 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3BP2P78314 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3BP2P78314 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3BP2P78314 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3BP2P78314 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3BP2P78314 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3BP2P78314 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3BP2P78314 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3BP2P78314 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SH3BP2P78314 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3BP2P78314 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3BP2P78314 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3BP2P78314 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3BP2P78314 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3BP2P78314 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3BP2P78314 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3BP2P78314 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2P78314 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2P78314 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2P78314 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
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