Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERVK_113P63132 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERVK_113P63132 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERVK_113P63132 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERVK_113P63132 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERVK_113P63132 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERVK_113P63132 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERVK_113P63132 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERVK_113P63132 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERVK_113P63132 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HERVK_113P63132 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HERVK_113P63132 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HERVK_113P63132 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HERVK_113P63132 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERVK_113P63132 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERVK_113P63132 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERVK_113P63132 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERVK_113P63132 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERVK_113P63132 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERVK_113P63132 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERVK_113P63132 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERVK_113P63132 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERVK_113P63132 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERVK_113P63132 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERVK_113P63132 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERVK_113P63132 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERVK_113P63132 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERVK_113P63132 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERVK_113P63132 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERVK_113P63132 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HERVK_113P63132 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERVK_113P63132 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERVK_113P63132 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERVK_113P63132 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERVK_113P63132 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERVK_113P63132 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERVK_113P63132 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HERVK_113P63132 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERVK_113P63132 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERVK_113P63132 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERVK_113P63132 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERVK_113P63132 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERVK_113P63132 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERVK_113P63132 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERVK_113P63132 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERVK_113P63132 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERVK_113P63132 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERVK_113P63132 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERVK_113P63132 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERVK_113P63132 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERVK_113P63132 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERVK_113P63132 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERVK_113P63132 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HERVK_113P63132 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERVK_113P63132 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERVK_113P63132 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113P63132 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113P63132 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113P63132 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113P63132 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113P63132 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HERVK_113P63132 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERVK_113P63132 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERVK_113P63132 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERVK_113P63132 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HERVK_113P63132 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERVK_113P63132 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms