Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VCPP55072 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VCPP55072 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VCPP55072 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VCPP55072 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VCPP55072 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
VCPP55072 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VCPP55072 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VCPP55072 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VCPP55072 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VCPP55072 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VCPP55072 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VCPP55072 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VCPP55072 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VCPP55072 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VCPP55072 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VCPP55072 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VCPP55072 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VCPP55072 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
VCPP55072 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VCPP55072 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VCPP55072 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VCPP55072 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VCPP55072 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VCPP55072 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VCPP55072 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VCPP55072 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VCPP55072 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
VCPP55072 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VCPP55072 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
VCPP55072 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VCPP55072 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VCPP55072 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VCPP55072 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VCPP55072 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VCPP55072 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VCPP55072 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VCPP55072 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VCPP55072 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VCPP55072 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VCPP55072 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VCPP55072 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VCPP55072 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VCPP55072 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VCPP55072 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VCPP55072 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VCPP55072 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VCPP55072 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VCPP55072 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VCPP55072 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VCPP55072 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VCPP55072 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VCPP55072 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VCPP55072 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VCPP55072 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VCPP55072 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VCPP55072 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VCPP55072 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VCPP55072 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VCPP55072 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VCPP55072 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VCPP55072 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VCPP55072 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VCPP55072 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
VCPP55072 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
VCPP55072 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VCPP55072 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VCPP55072 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VCPP55072 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VCPP55072 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
VCPP55072 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VCPP55072 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VCPP55072 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VCPP55072 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VCPP55072 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VCPP55072 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
VCPP55072 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VCPP55072 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
VCPP55072 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VCPP55072 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VCPP55072 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VCPP55072 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VCPP55072 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VCPP55072 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VCPP55072 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VCPP55072 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
VCPP55072 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VCPP55072 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VCPP55072 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
VCPP55072 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VCPP55072 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VCPP55072 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VCPP55072 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VCPP55072 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VCPP55072 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VCPP55072 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VCPP55072 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VCPP55072 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VCPP55072 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VCPP55072 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.1 ms