Protein–RNA interactions for Protein: P54219

SLC18A1, Chromaffin granule amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A1P54219 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC18A1P54219 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC18A1P54219 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC18A1P54219 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC18A1P54219 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC18A1P54219 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC18A1P54219 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC18A1P54219 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC18A1P54219 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC18A1P54219 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC18A1P54219 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC18A1P54219 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC18A1P54219 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC18A1P54219 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC18A1P54219 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC18A1P54219 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC18A1P54219 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC18A1P54219 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC18A1P54219 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC18A1P54219 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC18A1P54219 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC18A1P54219 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC18A1P54219 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC18A1P54219 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC18A1P54219 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC18A1P54219 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC18A1P54219 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC18A1P54219 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC18A1P54219 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC18A1P54219 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC18A1P54219 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC18A1P54219 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC18A1P54219 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC18A1P54219 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC18A1P54219 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC18A1P54219 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC18A1P54219 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC18A1P54219 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC18A1P54219 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC18A1P54219 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC18A1P54219 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC18A1P54219 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC18A1P54219 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC18A1P54219 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC18A1P54219 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC18A1P54219 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC18A1P54219 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC18A1P54219 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC18A1P54219 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC18A1P54219 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC18A1P54219 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC18A1P54219 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC18A1P54219 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC18A1P54219 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC18A1P54219 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC18A1P54219 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC18A1P54219 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC18A1P54219 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC18A1P54219 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC18A1P54219 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC18A1P54219 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC18A1P54219 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC18A1P54219 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC18A1P54219 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC18A1P54219 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC18A1P54219 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC18A1P54219 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC18A1P54219 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC18A1P54219 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC18A1P54219 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC18A1P54219 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC18A1P54219 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC18A1P54219 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC18A1P54219 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC18A1P54219 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC18A1P54219 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC18A1P54219 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC18A1P54219 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC18A1P54219 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC18A1P54219 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC18A1P54219 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms