Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC24CP53992 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC24CP53992 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC24CP53992 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC24CP53992 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SEC24CP53992 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC24CP53992 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC24CP53992 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC24CP53992 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC24CP53992 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC24CP53992 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC24CP53992 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC24CP53992 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC24CP53992 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC24CP53992 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC24CP53992 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC24CP53992 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC24CP53992 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC24CP53992 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC24CP53992 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC24CP53992 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC24CP53992 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC24CP53992 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC24CP53992 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC24CP53992 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC24CP53992 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24CP53992 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24CP53992 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24CP53992 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24CP53992 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24CP53992 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC24CP53992 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC24CP53992 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC24CP53992 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC24CP53992 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC24CP53992 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC24CP53992 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC24CP53992 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24CP53992 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24CP53992 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24CP53992 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC24CP53992 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC24CP53992 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC24CP53992 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24CP53992 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC24CP53992 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24CP53992 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24CP53992 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24CP53992 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24CP53992 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC24CP53992 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC24CP53992 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC24CP53992 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC24CP53992 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC24CP53992 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC24CP53992 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC24CP53992 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEC24CP53992 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEC24CP53992 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEC24CP53992 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SEC24CP53992 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEC24CP53992 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEC24CP53992 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC24CP53992 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC24CP53992 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC24CP53992 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC24CP53992 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms