Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2A1P52655 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2A1P52655 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2A1P52655 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2A1P52655 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2A1P52655 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2A1P52655 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2A1P52655 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2A1P52655 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2A1P52655 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2A1P52655 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2A1P52655 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2A1P52655 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2A1P52655 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2A1P52655 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2A1P52655 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2A1P52655 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2A1P52655 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2A1P52655 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2A1P52655 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2A1P52655 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2A1P52655 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2A1P52655 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2A1P52655 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2A1P52655 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2A1P52655 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2A1P52655 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2A1P52655 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2A1P52655 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2A1P52655 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2A1P52655 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2A1P52655 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2A1P52655 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2A1P52655 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2A1P52655 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2A1P52655 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2A1P52655 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2A1P52655 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2A1P52655 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2A1P52655 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2A1P52655 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2A1P52655 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2A1P52655 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2A1P52655 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2A1P52655 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2A1P52655 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2A1P52655 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2A1P52655 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2A1P52655 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2A1P52655 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2A1P52655 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2A1P52655 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2A1P52655 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2A1P52655 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2A1P52655 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2A1P52655 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2A1P52655 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2A1P52655 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2A1P52655 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2A1P52655 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2A1P52655 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2A1P52655 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2A1P52655 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GTF2A1P52655 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GTF2A1P52655 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2A1P52655 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2A1P52655 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2A1P52655 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2A1P52655 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2A1P52655 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2A1P52655 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2A1P52655 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2A1P52655 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2A1P52655 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2A1P52655 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2A1P52655 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2A1P52655 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2A1P52655 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2A1P52655 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2A1P52655 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2A1P52655 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2A1P52655 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2A1P52655 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2A1P52655 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2A1P52655 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2A1P52655 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF2A1P52655 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF2A1P52655 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2A1P52655 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2A1P52655 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2A1P52655 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2A1P52655 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2A1P52655 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2A1P52655 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2A1P52655 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2A1P52655 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2A1P52655 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2A1P52655 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2A1P52655 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2A1P52655 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms