Protein–RNA interactions for Protein: P50395

GDI2, Rab GDP dissociation inhibitor beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI2P50395 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDI2P50395 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDI2P50395 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDI2P50395 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDI2P50395 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDI2P50395 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDI2P50395 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDI2P50395 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDI2P50395 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GDI2P50395 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDI2P50395 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDI2P50395 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDI2P50395 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDI2P50395 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDI2P50395 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDI2P50395 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDI2P50395 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDI2P50395 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDI2P50395 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDI2P50395 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDI2P50395 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDI2P50395 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDI2P50395 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDI2P50395 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDI2P50395 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GDI2P50395 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDI2P50395 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDI2P50395 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDI2P50395 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDI2P50395 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDI2P50395 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDI2P50395 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDI2P50395 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDI2P50395 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDI2P50395 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GDI2P50395 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDI2P50395 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDI2P50395 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDI2P50395 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDI2P50395 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDI2P50395 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDI2P50395 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDI2P50395 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDI2P50395 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDI2P50395 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDI2P50395 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDI2P50395 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDI2P50395 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDI2P50395 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDI2P50395 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDI2P50395 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDI2P50395 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDI2P50395 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDI2P50395 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDI2P50395 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDI2P50395 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDI2P50395 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDI2P50395 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDI2P50395 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDI2P50395 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GDI2P50395 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDI2P50395 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDI2P50395 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDI2P50395 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDI2P50395 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDI2P50395 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GDI2P50395 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GDI2P50395 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
GDI2P50395 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GDI2P50395 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDI2P50395 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDI2P50395 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GDI2P50395 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDI2P50395 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDI2P50395 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDI2P50395 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDI2P50395 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDI2P50395 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDI2P50395 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDI2P50395 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDI2P50395 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDI2P50395 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDI2P50395 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDI2P50395 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDI2P50395 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDI2P50395 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDI2P50395 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDI2P50395 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDI2P50395 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDI2P50395 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDI2P50395 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDI2P50395 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDI2P50395 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDI2P50395 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDI2P50395 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDI2P50395 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDI2P50395 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GDI2P50395 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDI2P50395 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDI2P50395 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms