Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CENPFP49454 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CENPFP49454 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CENPFP49454 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CENPFP49454 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CENPFP49454 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CENPFP49454 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CENPFP49454 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CENPFP49454 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CENPFP49454 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CENPFP49454 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CENPFP49454 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CENPFP49454 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CENPFP49454 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CENPFP49454 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CENPFP49454 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CENPFP49454 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CENPFP49454 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CENPFP49454 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CENPFP49454 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CENPFP49454 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CENPFP49454 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CENPFP49454 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CENPFP49454 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CENPFP49454 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CENPFP49454 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CENPFP49454 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CENPFP49454 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CENPFP49454 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CENPFP49454 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CENPFP49454 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CENPFP49454 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CENPFP49454 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CENPFP49454 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CENPFP49454 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CENPFP49454 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CENPFP49454 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CENPFP49454 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CENPFP49454 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CENPFP49454 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CENPFP49454 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CENPFP49454 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CENPFP49454 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CENPFP49454 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CENPFP49454 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CENPFP49454 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CENPFP49454 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CENPFP49454 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CENPFP49454 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CENPFP49454 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CENPFP49454 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CENPFP49454 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CENPFP49454 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CENPFP49454 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CENPFP49454 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CENPFP49454 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CENPFP49454 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CENPFP49454 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CENPFP49454 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CENPFP49454 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CENPFP49454 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CENPFP49454 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CENPFP49454 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CENPFP49454 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPFP49454 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
CENPFP49454 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPFP49454 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPFP49454 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPFP49454 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPFP49454 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPFP49454 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPFP49454 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPFP49454 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPFP49454 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPFP49454 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPFP49454 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPFP49454 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPFP49454 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPFP49454 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPFP49454 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPFP49454 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPFP49454 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPFP49454 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPFP49454 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPFP49454 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPFP49454 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPFP49454 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPFP49454 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CENPFP49454 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CENPFP49454 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CENPFP49454 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPFP49454 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPFP49454 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPFP49454 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPFP49454 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPFP49454 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPFP49454 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CENPFP49454 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CENPFP49454 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPFP49454 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms