Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMD8P48556 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMD8P48556 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSMD8P48556 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSMD8P48556 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMD8P48556 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMD8P48556 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMD8P48556 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMD8P48556 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMD8P48556 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMD8P48556 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMD8P48556 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMD8P48556 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMD8P48556 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMD8P48556 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMD8P48556 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMD8P48556 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMD8P48556 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMD8P48556 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMD8P48556 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMD8P48556 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMD8P48556 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMD8P48556 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMD8P48556 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMD8P48556 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMD8P48556 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMD8P48556 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMD8P48556 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PSMD8P48556 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSMD8P48556 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSMD8P48556 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMD8P48556 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMD8P48556 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMD8P48556 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMD8P48556 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMD8P48556 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMD8P48556 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMD8P48556 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMD8P48556 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMD8P48556 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMD8P48556 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMD8P48556 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMD8P48556 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMD8P48556 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMD8P48556 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMD8P48556 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMD8P48556 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMD8P48556 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMD8P48556 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMD8P48556 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMD8P48556 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMD8P48556 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMD8P48556 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD8P48556 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD8P48556 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD8P48556 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD8P48556 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMD8P48556 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMD8P48556 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMD8P48556 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD8P48556 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD8P48556 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD8P48556 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD8P48556 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD8P48556 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD8P48556 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD8P48556 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD8P48556 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD8P48556 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD8P48556 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD8P48556 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD8P48556 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD8P48556 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD8P48556 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD8P48556 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD8P48556 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD8P48556 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD8P48556 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSMD8P48556 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMD8P48556 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMD8P48556 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD8P48556 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD8P48556 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD8P48556 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD8P48556 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD8P48556 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD8P48556 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD8P48556 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD8P48556 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD8P48556 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD8P48556 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD8P48556 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD8P48556 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD8P48556 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD8P48556 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD8P48556 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD8P48556 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD8P48556 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD8P48556 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD8P48556 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms