Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA7P36544 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA7P36544 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA7P36544 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms