Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHKAP35790 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHKAP35790 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHKAP35790 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHKAP35790 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHKAP35790 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHKAP35790 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHKAP35790 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHKAP35790 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHKAP35790 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHKAP35790 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHKAP35790 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHKAP35790 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHKAP35790 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHKAP35790 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHKAP35790 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHKAP35790 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHKAP35790 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHKAP35790 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHKAP35790 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHKAP35790 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHKAP35790 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHKAP35790 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHKAP35790 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CHKAP35790 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHKAP35790 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHKAP35790 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHKAP35790 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CHKAP35790 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHKAP35790 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHKAP35790 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHKAP35790 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHKAP35790 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHKAP35790 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHKAP35790 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHKAP35790 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHKAP35790 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHKAP35790 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHKAP35790 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHKAP35790 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CHKAP35790 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHKAP35790 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHKAP35790 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHKAP35790 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHKAP35790 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHKAP35790 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHKAP35790 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHKAP35790 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHKAP35790 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHKAP35790 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHKAP35790 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHKAP35790 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHKAP35790 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHKAP35790 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHKAP35790 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHKAP35790 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHKAP35790 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHKAP35790 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHKAP35790 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHKAP35790 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHKAP35790 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHKAP35790 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHKAP35790 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHKAP35790 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHKAP35790 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHKAP35790 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHKAP35790 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHKAP35790 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHKAP35790 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHKAP35790 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHKAP35790 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHKAP35790 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHKAP35790 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHKAP35790 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHKAP35790 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHKAP35790 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHKAP35790 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CHKAP35790 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHKAP35790 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHKAP35790 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHKAP35790 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CHKAP35790 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHKAP35790 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHKAP35790 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHKAP35790 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHKAP35790 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHKAP35790 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHKAP35790 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHKAP35790 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHKAP35790 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHKAP35790 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHKAP35790 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHKAP35790 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHKAP35790 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHKAP35790 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHKAP35790 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CHKAP35790 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CHKAP35790 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CHKAP35790 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHKAP35790 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms