Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX11P35716 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX11P35716 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX11P35716 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX11P35716 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX11P35716 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX11P35716 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX11P35716 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX11P35716 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX11P35716 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX11P35716 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX11P35716 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX11P35716 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX11P35716 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX11P35716 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX11P35716 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX11P35716 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX11P35716 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX11P35716 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX11P35716 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX11P35716 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX11P35716 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX11P35716 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX11P35716 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX11P35716 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX11P35716 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX11P35716 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX11P35716 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX11P35716 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX11P35716 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX11P35716 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX11P35716 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX11P35716 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX11P35716 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX11P35716 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX11P35716 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX11P35716 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX11P35716 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX11P35716 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SOX11P35716 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SOX11P35716 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SOX11P35716 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SOX11P35716 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX11P35716 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX11P35716 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX11P35716 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX11P35716 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX11P35716 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX11P35716 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX11P35716 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX11P35716 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX11P35716 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX11P35716 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX11P35716 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX11P35716 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX11P35716 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX11P35716 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX11P35716 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX11P35716 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX11P35716 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX11P35716 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX11P35716 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX11P35716 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX11P35716 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX11P35716 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX11P35716 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX11P35716 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX11P35716 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX11P35716 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX11P35716 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX11P35716 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX11P35716 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX11P35716 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX11P35716 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX11P35716 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX11P35716 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX11P35716 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX11P35716 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX11P35716 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX11P35716 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX11P35716 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX11P35716 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX11P35716 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX11P35716 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX11P35716 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX11P35716 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX11P35716 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX11P35716 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX11P35716 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX11P35716 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX11P35716 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX11P35716 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX11P35716 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX11P35716 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX11P35716 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX11P35716 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX11P35716 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX11P35716 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX11P35716 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX11P35716 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms