Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPRR1AP35321 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRR1AP35321 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms