Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNNB1P35222 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNNB1P35222 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNNB1P35222 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNNB1P35222 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNNB1P35222 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNNB1P35222 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNNB1P35222 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNNB1P35222 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTNNB1P35222 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTNNB1P35222 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTNNB1P35222 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CTNNB1P35222 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTNNB1P35222 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CTNNB1P35222 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTNNB1P35222 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTNNB1P35222 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTNNB1P35222 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTNNB1P35222 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTNNB1P35222 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTNNB1P35222 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTNNB1P35222 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTNNB1P35222 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTNNB1P35222 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNNB1P35222 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNNB1P35222 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNNB1P35222 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTNNB1P35222 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTNNB1P35222 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTNNB1P35222 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTNNB1P35222 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTNNB1P35222 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CTNNB1P35222 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTNNB1P35222 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTNNB1P35222 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTNNB1P35222 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTNNB1P35222 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CTNNB1P35222 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNNB1P35222 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNNB1P35222 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNNB1P35222 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNNB1P35222 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNNB1P35222 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNNB1P35222 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNNB1P35222 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNNB1P35222 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNNB1P35222 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNNB1P35222 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTNNB1P35222 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTNNB1P35222 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTNNB1P35222 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CTNNB1P35222 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTNNB1P35222 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CTNNB1P35222 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
CTNNB1P35222 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTNNB1P35222 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTNNB1P35222 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTNNB1P35222 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTNNB1P35222 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CTNNB1P35222 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTNNB1P35222 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTNNB1P35222 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTNNB1P35222 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTNNB1P35222 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CTNNB1P35222 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTNNB1P35222 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTNNB1P35222 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTNNB1P35222 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTNNB1P35222 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTNNB1P35222 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTNNB1P35222 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTNNB1P35222 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTNNB1P35222 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTNNB1P35222 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTNNB1P35222 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTNNB1P35222 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTNNB1P35222 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTNNB1P35222 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTNNB1P35222 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTNNB1P35222 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTNNB1P35222 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTNNB1P35222 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTNNB1P35222 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTNNB1P35222 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTNNB1P35222 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTNNB1P35222 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNB1P35222 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNB1P35222 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNB1P35222 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNB1P35222 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNB1P35222 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNB1P35222 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNB1P35222 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNB1P35222 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTNNB1P35222 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTNNB1P35222 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTNNB1P35222 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTNNB1P35222 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTNNB1P35222 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTNNB1P35222 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms