Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCND3P30281 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCND3P30281 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCND3P30281 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCND3P30281 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCND3P30281 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCND3P30281 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCND3P30281 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCND3P30281 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CCND3P30281 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCND3P30281 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCND3P30281 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCND3P30281 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCND3P30281 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCND3P30281 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCND3P30281 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCND3P30281 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCND3P30281 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCND3P30281 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCND3P30281 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCND3P30281 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCND3P30281 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCND3P30281 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCND3P30281 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCND3P30281 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCND3P30281 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCND3P30281 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCND3P30281 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCND3P30281 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCND3P30281 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCND3P30281 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCND3P30281 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCND3P30281 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCND3P30281 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCND3P30281 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCND3P30281 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCND3P30281 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCND3P30281 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCND3P30281 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCND3P30281 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCND3P30281 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCND3P30281 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCND3P30281 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCND3P30281 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCND3P30281 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCND3P30281 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCND3P30281 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCND3P30281 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCND3P30281 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCND3P30281 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCND3P30281 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCND3P30281 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCND3P30281 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CCND3P30281 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCND3P30281 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCND3P30281 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCND3P30281 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCND3P30281 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCND3P30281 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCND3P30281 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCND3P30281 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCND3P30281 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCND3P30281 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCND3P30281 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCND3P30281 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCND3P30281 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCND3P30281 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CCND3P30281 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCND3P30281 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCND3P30281 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCND3P30281 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCND3P30281 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CCND3P30281 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCND3P30281 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CCND3P30281 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCND3P30281 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCND3P30281 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCND3P30281 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CCND3P30281 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCND3P30281 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCND3P30281 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCND3P30281 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCND3P30281 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCND3P30281 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCND3P30281 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCND3P30281 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCND3P30281 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCND3P30281 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCND3P30281 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCND3P30281 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CCND3P30281 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CCND3P30281 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCND3P30281 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCND3P30281 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCND3P30281 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCND3P30281 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCND3P30281 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCND3P30281 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCND3P30281 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCND3P30281 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.3 ms